Kolorektální karcinom patří mezi nejčetnější nádorová onemocnění v České republice a je druhou nejčastější příčinou nádorových úmrtí v západních zemích. I když se spektrum terapeutických přístupů pro onemocnění ve stádiu vzdálených metastáz rozšířilo o možnosti cílené léčby, není pětileté celkové přežívání (OS) zdaleka uspokojivé. Vyhodnocení individuálního rizika na základě přítomnosti kandidátních polymorfizmů v genech významných v patogenezi tohoto onemocnění by bylo velice přínosné především v rámci možnosti individualizovaného nastavení preventivních opatření u vulnerabilních jedinců. MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující RNA, které mají schopnost post transkripčně regulovat genovou expresi, a podílet se tak na inhibici translace řady onkogenů či nádorových supresorů. Geny regulované pomocí miRNA však nejsou pouze součástí procesu kancerogeneze, nýbrž se podílejí i na nádorové invazivitě, diseminaci a lékové rezistenci. Byla popsána celá řada jednonukleotidových polymorfizmů (SNP) jak přímo v sekvencích miRNA tak v jejich vazebných oblastech v rámco 3UTR oblastí cílových mRNA, které ovlivňují riziko vzniku nádorových onemocnění včetně kolorektálního karcinomu. V rámci DP studentka provede asociační studii vybraných SNP v genech či vazebných oblastech pro miRNA a kolorektálního karcinomu, přičemž výskyt polymorfizmů bude hodnotit i ve vztahu k vybraným demografickým údajům (pohlaví, věk, komorbidity, BMI, a další). Studované SNP bude analyzovat rovněž in vitro za účelem prokázání jejich vlivu na chování příslušné miRNA ve smyslu ovlivnění její biogeneze případně afinity k vazebné místu na cílové mRNA. Použité metody: izolace DNA a celkové RNA obohacené o frakce krátkých RNA ze séra, reverzní transkripce, qRT-PCR, alelická diskriminace, elektroforéza, kultivace buněk, transfekce, studium apoptózy a buněčného cyklu, western blot, statistická analýza dat.