Bakalářská práce

Webové rozhraní pro zpracování experimentu SAXS

Web interface for processing SAXS experimental data

Jaroslav Čabala
Anotace

Táto bakalárska práca je zameraná na návrh a implementáciu webovej aplikácie pre zobrazovanie výsledkov experimentálnej metódy vyvíjanej Masarykovou univerzitou. Práca obsahuje postupne analýzu požadovanej funkcionality, zhrnutie použitých nástrojov a technológií a popis implementácie aplikácie.

Abstract

The thesis is aimed on design and developing of an a web application for displaying result of an experimental method that is being developed by Masaryk university. Thesis contains an analysis of required funcionality, summary of used tools and technologies and description of implementation of this application.

Zadání práce
SAXS je experimentální metoda, která na základě měření ohybu rentgenových paprsků dokáže v kombinaci s dalšími vstupy určit tvar makromolekuly (zpravidla proteinu). Na MU vyvíjíme inovovanou metodu zpracování těchto dat.

Cílem této práce je navrhnout a implementovat webové rozhraní podobné http://modbase.compbio.ucsf.edu/foxs/index.html, které uživateli dovolí zadat vstupní data, spustí výpočet, a ve vhodné formě (grafy, 3D visualizace) a s využitím existujících knihoven zobrazí výsledky. Aplikace bude rozlišovat mezi uživateli, konkrétnímu uživateli nabídne přístup pouze k výsledkům jeho výpočtů.

Implementace bude zahrnovat kompletní kód klientské strany (webový prohlížeč) -- interaktivní aplikace zobrazení molekul a grafu experimentálních dat, a triviální serverovou část, která pouze uloží zadaná uživatelská data a umožní klientovi načíst výsledky výpočtu. Implementace výkonné části serveru (analýza dat) není předmětem této práce, je vyvíjena paralelně.

Aplikace bude instalována v cloudu centra CERIT-SC (www.cerit-sc.cz), očekávaným výstupem práce je funkční prototyp.

Práce zkontrolována:
6. 1. 2016 09:32, Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
8. 2. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
SKS OProj ÚVT MU

Oponent

RNDr. Martin Kuba, Ph.D., učo 3988
UOGI OProj ÚVT MU

Konzultant

RNDr. Tomáš Raček, Ph.D., učo 324965
NCBR PřF MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.