S narůstajícím výskytem multirezistentních kmenů bakterií je nutné hledat nové přístupy ve studiu a léčbě komplikovaných bakteriálních superinfekcí. Jako potenciální náhrada antibiotik se objevují alternativní lyzační agens, jako jsou např. lytické enzymy, fágy, peptidy nebo nanoroboti, včetně jejich synergií. Pro detailní charakterizaci lyze je nutné mít k dispozici analytické metody, které budou nejen dostatečně citlivé a rychlé, ale také umožní automatizaci pro analýzu velkého množství vzorků. Velký potenciál mají především biosensory na bázi křemenných mikrovážek (quartz crystal microbalance, QCM) a povrchové plazmonové rezonance (surface plasmon resonance, SPR), které umožnují sledovat změny na povrchu sensoru v reálném čase bez nutnosti značení. Mikroskopické techniky jako fluorescenční mikroskopie a mikroskopie atomárních sil (atomic force microscopy, AFM) umožňují získat detailní informace o struktuře povrchu, AFM pak kromě topografie měří také mechanické vlastnosti vzorku.

Cílem této práce je vyvinout a optimalizovat metodu pro studium lýze bakterií a biofilmů pomocí různých lytických činidel. První část práce bude zaměřena na kultivaci modelové bakterie (Staphylococcus aureus) a přípravu biofilmů. Následně budou srovnány různé způsoby imobilizace s cílem dosáhnout co nejlepší životaschopnosti imobilizovaných bakterií. Po optimalizaci kultivace a imobilizace bakterií bude studována jejich lýze pomocí pokročilých biofyzikálních přístupů, jako je QCM, SPR nebo AFM. Referenční měření budou založena na optické (fluorescenční) mikroskopii.