Bakalářská práce

Srovnávací genomika trav, současné trendy a aplikace poznatků

Comparative genomics of cereals and applications

Jana Simandlová, učo 324240
Anotace

Bakalářská práce se zabývá aktuálními trendy srovnávací genomiky modelových i kulturních druhů čeledě Poaceae. V práci jsou shrnuty informace o genomech významných zástupců této čeledě a současné poznatky o jejich evoluci a o syntenii jednotlivých druhů. Jsou zde také popsány hlavní nástroje využívané při analýze těchto genomů, a to mutageneze jako nástroj studia funkcí genů, genetické a fyzické mapování …více

Abstract

The thesis deals with the current trends of comparative genomics of models and crops from the family Poaceae. The thesis summarizes information about significant cereal genomes and knowledge about their evolution and synteny. Main tools used for analysis of genomes, namely mutagenesis aimed at study of gene functions, genetic and physical mapping and sequencing considering up-to-date trends (e.g. next …více

Zadání práce
Bakalářská práce shrne současné poznatky o genomech významných rostlinných druhů – obilovin (trav; Graminae). Poznatky o syntenii, makro- a mikrokolinearitě druhů jako je ječmen, pšenice a rýže mohou mít praktické dopady. Jde o téma aktuální z hlediska základního i aplikovaného výzkumu rostlin. Poznatky o konsensuálních genetických mapách a DNA markerech v genetice a šlechtění obilovin jsou zaměřené na identifikaci markerů v těsné vazbě s významnými geny s perspektivou využití při tzv. markery asistovaném šlechtění a při tvorbě nových odrůd. Bakalářská práce se zaměří také na současné trendy v metodách sekvenování nové generace jako je Illumina a SOLiD. Takto získané sekvence jsou ideální pro další analýzu konkrétních genotypů, např. pro identifikaci jednonukleotidových polymorfizmů a vývoj markerů SNP nebo při identifikaci kandidátních genů. Do popředí se také dostává nezbytnost bioinformatických nástrojů při analýze takového obrovského množství dat. Dalším trendem při odhalování polymorfizmu je navrhování DNA čipů a jejich využití při asociačním mapování významných znaků.
Práce zkontrolována:
12. 5. 2011 07:43, prof. RNDr. Jana Řepková, CSc., učo 530
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
16. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jana Řepková, CSc., učo 530
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.