Bakalářská práce

Biochemicky významné motivy v putativních proteinech

Biochemically significant motifs in putative proteins

Lukáš Hanušovský
Anotace

V súčasnej dobe máme k dispozícii stále viac a viac 3D štruktúru proteínov, ktoré majú neznámu funkciu – domnelý protein. Úlohou mojej bakalárskej práce bolo overiť, či je možné odhadnúť funkciu týchto proteínov na základe toho, že obsahujú rovnaké väzobné miesto ako proteín, ktorého funkciu poznáme. V kontexte mojej práce, som tento prístup aplikoval na väzobné miesta kovov. Následne som bol schopný …více

Abstract

Currently there are more and more available 3D structures of proteins, which have the unknown function – putative proteins. Task of my thesis was to test whether it is possible to estimate the function of these proteins on the basis that they contain the same binding sites as protein whose function we know. In the context of my work, I applied this approach and I worked with metal binding sites. Subsequently …více

Klíčová slova
Putative proteins sugar metal binding sites motifs superimposing functions. Domnelý proteín cukor kov väzbové miesta motívy vrstvením funkcie.
Zadání práce
V současné době je dostupné velké množství informací o 3D struktuře proteinů, u některých z těchto proteinů však ale neznáme jejich funkci. Tyto proteiny označujeme jako putativní. Pro identifikaci funkce proteinů lze využít informaci o biochemicky významných motivech v rámci proteinů. Tímto tématem se zabývá tato bakalářská práce, přičemž její konkrétní cíle jsou:
  • Vyhledání putativních proteinů v databázi Protein Data Bank
  • Nalezení biochemicky významných motivů v rámci těchto proteinů - konkrétně vazebných míst kovů nebo cukrů.
  • Predikce funkce putativních proteinů na základě výskytu uvedených motivů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
20. 5. 2011 03:45, prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
17. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
abs PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Lukáš Hanušovský PřF B-BCH CHI ceytj/6
Hanušovský, L.
12. 5. 2011
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Hanušovský, L.
12. 5. 2011
Anotace česky annotation.txt
Hanušovský, L.
12. 5. 2011
Klíčová slova keywords.txt
Hanušovský, L.
12. 5. 2011
Posudek_oponenta.doc
Prokop, M.
14. 6. 2011
Thesis Bachelor_thesis_LH_new.pdf
Hanušovský, L.
12. 5. 2011

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.