Disertační práce

Aplikace bioinformatických přístupů pro analýzu struktury rostlinných genomů

Bioinformatic approaches for structural analysis of plant genomes

Mgr. Petra Hloušková, učo 141799
Anotace

Vyšší rostliny jsou známé svou extrémní variabilitou ve velikosti genomu, způsobenou buďto polyploidií a/nebo proliferací repetitivních sekvencí. Kromě jaderného genomu rostlinné buňky obsahují extranukleární, chloroplastové a mitochondriální genomy. Zejména chloroplastové sekvence představují užitečný zdroj informací pro řešení fylogenetických vztahů na různých taxonomických úrovních. Prvním cílem …více

Abstract

Land plants are well known for their extensive genome size variation. The genome size range is primarily caused by polyploidy and/or proliferation of repetitive sequences. In addition to the nuclear genome, plant cells contain extranuclear, chloroplast and mitochondrial genomes. In particular, chloroplast sequences are useful to resolve the phylogenetic relationships at different taxonomic levels. …více

Klíčová slova
Rostlinný genom Variabilita ve velikosti genomu Repetitivní DNA Transpozibilní elementy Retrotranspozony Tandemové repetice Chloroplastová DNA Fylogenetika Assembly Identifikace repetic Sekvenování nové generace Plant genome Genome size variability Repetitive DNA Transposable elements Retrotransposons Tandem repeats Chloroplast DNA Phylogenetics Repeat identification Next generation sequencing
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
4. 3. 2020 15:58, prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc., učo 204166
Plný text práce
7,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
24. 4. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc., učo 204166
ÚEB Biol PřF MU

Oponenti

Mgr. Eva Hřibová, Ph.D., učo 239503
UEB AVČR, Olomouc
Mgr. Vratislav Peška, Ph.D., učo 21286
abs PřF MU, BFU AVČR, Brno

Konzultant

RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D., učo 64119
CGR MCGPR CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Genomika a proteomika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.