Bakalářská práce

Jaderné faktory interagující s telomerázou

Nuclear factors interacting with telomerase

Polina Shpet
Anotace

V této bakalářské práci se věnujeme hledání jaderných faktorů schopných přímo interagovat s katalytickou podjednotkou telomerázy (AtTERT) a POT1a proteinem u modelové rostliny Arabidopsis thaliana. Skrze protein-proteinové interakce enzym plní svoje primární funkce či funkce nezávislé na prodlužování telomer. Lidská telomeráza a její interakční partneři jsou aktivně studováni, ale o rostlinném enzymu …více

Abstract

In this thesis, we were searching for nuclear factors capable of direct interactions with the catalytic telomerase subunit (AtTERT) and the POT1a protein from model plant Arabidopsis thaliana. Through protein-protein interactions, the enzyme performs its primary functions or functions independent of telomere lengthening. Human telomerase and its interaction partners are intensively studied, but very …více

Klíčová slova
Arabidopsis thaliana Jaderné faktory Telomeráza TERT Telomera Protein-proteinové interakce DNA zlomy Mechanizmy oprav zlomů DNA Kvasinkový dvouhybridní systém Nuclear factors Telomerase Telomere Protein-protein interactions DNA breaks Mechanisms of DNA damage repair Yeast Two-Hybrid
Zadání práce
Telomery jsou nukleoproteinové komplexy tvořící přirozené konce lineárních chromozomů. Při buněčném dělení dochází k postupnému zkracování telomer v důsledku neschopnosti DNA-polymeráz replikovat úplný konec opožďujícího se vlákna DNA. Dosáhne-li délka telomer kritickou mez, buňka ztrácí schopnost dělení. Aby k tomu nedošlo a buňka měla neomezenou proliferační kapacitu, je potřeba zabránit zkracování telomer. K tomu slouží speciální enzym telomeráza, která je schopna syntetizovat telomerovou DNA. Využívá k tomu vlastní RNA podjednotku (TR), jejíž úsek slouží jako templát pro syntézu DNA při reverzní transkripci, kterou katalyzuje proteinová podjednotka telomerázy (TERT). Na RNA podjednotku i katalytickou podjednotku telomerázy se mohou vázat další proteiny. Skrze tyto interakce je ovlivňováno fungování telomerázy, načasování jejího působení v průběhu buněčného cyklu, přístup k chromozomovým koncům. Kromě prodlužování telomer plní katalytická podjednotka telomerázy i další tzv. netelomerické funkce, které se ukazují být biologicky významné. Teoretickou část bakalářské práce by měla představovat literární rešerše týkající se současných poznatků o proteinech asociovaných s telomerázou a o jejich roli. V praktické části bakalářské práce budou u modelové rostliny Arabidopsis thaliana testovány interakce několika jaderných faktorů s katalytickou podjednotkou telomerázy a také s jejími již známými interakčními partnery. S využitím klonovacího systému Gateway budou vloženy geny pro jaderné faktory vybrané na základě dříve provedené tandemové afinitní purifikace (DP Jana Majerská, 2012) do vektorů pro Y2H a následně budou testovány vzájemné protein-proteinové interakce pomocí kvasinkového dvouhybridního testu (Y2H), případně koimunoprecipitací. Doporučená literatura: 1. Schmidt J.C, Cech T.R (2018) Human telomerase: biogenesis, trafficking, recruitment, and activation. Genes & Development 29: (1095-1105) 2. Majerska J, Sykorova E, Fajkus J (2011) Non-telomeric activities of telomerase. Mol BioSyst 7: 1013-1023 3. Chiodi I, Mondello Ch (2012) Telomere-independent functions of telomerase in nuclei, cytoplasm, and mitochondria. Frontiers in Oncology 2: 133 4. Hong J, Lee J. H, Chung I.K (2016) Telomerase activates transcription of cyclin D1 gene through an interaction with NOL1
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
17. 5. 2019 12:53, Mgr. Jana Fulnečková, Ph.D., učo 8208
Plný text práce
2,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
24. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jana Fulnečková, Ph.D., učo 8208
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Martina Dvořáčková, Ph.D., učo 51932
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.