Master's thesis

Analysis of the biology of novel regulators of the WNT/PCP pathway in Danio rerio

Analýza biologie nových regulátorů WNT/PCP dráhy v daniu pruhovaném

Bc. Zuzana Páleníčková, UČO 509318
Abstract

Identifikace nových regulátorů signální dráhy Wnt/Planární buněčné polarity (PCP) je klíčová pro prohloubení našeho porozumění tomuto komplexnímu systému. Tato diplomová práce se zaměřila na funkční testování kandidátních proteinů, dříve identifikovaných pomocí proteomiky, s využitím technologie CRISPR/Cas9 a modelového organismu dania pruhovaného (zebrafish). Kombinace bioinformatické analýzy a rešerše …more

Abstract

Identifying novel regulators of the Wnt/Planar Cell Polarity (PCP) signalling pathway is essential for advancing our understanding of this complex system. This Diploma thesis focused on the functional testing of candidate proteins, formerly identified through proteomics, using CRISPR/Cas9 genome editing and the zebrafish model. A combination of bioinformatic analysis and literature/database searches …more

Keywords
CRISPR/Cas9 dánio pruhované Wnt/PCP signální dráha nové regulátory fenotyp Cas9 zebrafish Wnt/PCP signalling pathway novel regulators phenotype
Thesis description

Hlavním tématem diplomové práce bude funkční analýza proteinů, které jsou potenciálními novými regulátory signální dráhy Wnt/PCP. Studentka naváže na předchozí projekt v laboratoři, který identifikoval interakční partnery proteinů zahrnutých ve Wnt/PCP dráze metodou BioID. V první fázi bude studentka hledat orthology proteinů interagujících s výše zmíněnými proteiny v modelovém organismu Danio rerio. Následně zoptimalizuje metodiku CRISPR/Cas9 na zmíněném modelovém organismu s využitím známých regulátorů Wnt dráhy jako pozitivních kontrol. Poté bude testovat funkci nových proteinů pomocí metody loss of function, a to s využitím takto optimalizované CRISPR/Cas9 technologie. Bude sledovat defekty vývoje spojené s poruchami funkce Wnt/PCP signální kaskády u mutantních jedinců. Studentka se zaměří zejména na poruchy konvergentní extenze v raném vývoji.

Administrative information
The thesis has been checked:
21/5/2025 07:49, prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D., UČO 11088
Full text of thesis
2,4 MB / file PDF
Attachments (1)
Language used
English English
Defence date
26/6/2025
The thesis was defended successfully

Supervisor

prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D., UČO 11088
ÚEB Biol PřF MU

Reader

Mgr. Kateřina Tomanová, Ph.D., UČO 150822
Zivoc ÚEB Biol PřF MU

Consultant

Mgr. Nikodém Zezula, Ph.D., UČO 451094
Zivoc ÚEB Biol PřF MU
Cite this text
Masaryk University Faculty of Science
Programme
Plan
Developmental Biology

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.