Bakalářská práce

Vznik a význam sekvenčních variant mikroRNA (izomiRs)

Biogenesis and significance of sequence variants in microRNAs (isomiRs)

Lucie Pifková
Anotace

MikroRNA patří do skupiny krátkých nekódující RNA, které na post-transkripční úrovni regulují genovou expresi a významně se tak podílejí na regulaci klíčových buněčných procesů. Podstatná je také jejich role při vzniku a progresi mnohých onemocnění. V současné době je věnována pozornost diagnostickému potenciálu mikroRNA a v rámci biomarkerových studií jsou analyzovány jejich expresní profily. Implementace …více

Abstract

MicroRNAs are a class of small non-coding RNAs which regulate gene expression at the post-transcriptional level and are significantly involved in the regulation of key cellular processes. They play an important role in the development of many diseases. Currently, the research of microRNAs is focused on diagnostic potential of these molecules and their expression profiles are analysed in many biomarker …více

Zadání práce
MikroRNA (miRNA) představují rozsáhlou skupinu endogenních nekódujících RNA, které hrají klíčovou roli v regulaci genové exprese. Nejnovější verze databáze miRNA miRbase zahrnuje 2656 maturovaných lidských tzv. kanonických molekul. Rozvoj vysokokapacitních metod a zejména sekvenování nové generace (NGS) však odhalil značnou heterogenitu ve smyslu existence sekvenčních variant těchto kanonických miRNA, tzv. izomiRs. Tyto varianty se vyznačují změnou v primární struktuře způsobené například post-transkripčními modifikacemi nebo nedokonalým sestřihem během biogenetické dráhy. Díky tomu mohou vykazovat jiné biologické vlastnosti, zejména změnu repertoáru cílových genů nebo změnu stability řetězce. Přesto, že existence izomiRs je obecně potvrzena a přijata, nebyla tato problematika dosud důkladně zkoumána, a to i navzdory skutečnosti, že některé izoformy miRNA mohou být více abundantní než jejich kanonické formy. Kromě sledování primární struktury a zastoupení jednotlivých izoforem je pozornost třeba věnovat také tomu, jakým způsobem ovlivňuje přítomnost izomiRs efektivitu analýzy miRNA a zda nemůže u konkrétních molekul zavádět do analýz chybovost. Cílem bakalářské práce je vypracovat rešerši shrnující současné poznatky o izoformách miRNA, a to jak z hlediska jejich vzniku, tak vlivu na analýzu miRNA nebo jejich významu v rámci klinického využití.
Práce zkontrolována:
16. 6. 2020 06:59, prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D., učo 42891
Plný text práce
1,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
8. 7. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D., učo 42891
BiolÚ Teorie LF MU

Oponent

doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D., učo 18245
ÚPF Teorie LF MU

Konzultant

Mgr. Petra Pokorná, Ph.D., učo 437141
MOnkII CMM CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.