Bakalářská práce

Interaktivní vizualizace 3D molekulárních motivů

Interactive Visualization of 3D Molecular Motifs

Jan Richter
Anotace

V dnešní době je velmi snadné získat rozmanitá molekulární data. Tato data jsou povětšinou v textovém formátu a mají specifické vlastnosti. Úkolem této práce je navrhnout a implementovat webovou aplikaci v jazyce C# využívající technologie ASP.NET MVC, která bude poskytovat potřebná API pro vizualizaci těchto dat (na základě jejich atributů) a rozhraní pro jejich interaktivní prohlížení. Dalším požadavkem …více

Abstract

It is very easy to obtain various molecular data nowadays. This data is usually in text format and it has specific properties. The aim of this thesis is to design and implement a web application in C# programming language using the technology ASP.NET MVC, which will provide APIs necessary to visualize this data (based on its properties) and interfaces for its interactive exploring. The next requirement …více

Zadání práce
Cílem této práce je vytvoření webové aplikace v jazyku C# (s použitím technologie ASP.NET MVC) pro interaktivní vizualizaci 3D molekulárních motivů. 3D molekulární motiv je postruktura (obvykle s desítkami atomů) větsích molekul (např. proteinů), pro kterou lze definovat různé deskriptory (náboje, fingerprint, atd.) a metriky (počet spolecných atomů, RMSD, rozdíl nábojů, atd.). Navržené řešení by mělo uživateli umožnit "vizuálně prozkoumat" prostor molekulárních motivů, který je definován výše zmíněnýmí deskriptory a metrikami. Konkrétní přístup k problému je ponechán na řešiteli, práce by však měla obsahovat rešeršní část s přehledem metod vizualizace.
Práce zkontrolována:
17. 5. 2013 10:20, RNDr. David Sehnal, Ph.D., učo 140435
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. David Sehnal, Ph.D., učo 140435
NCBR PřF MU

Oponent

prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
CF BioData CSB CEITEC MU

Literatura

  • YAU, Nathan. Visualize this : the FlowingData guide to design, visualization, and statistics. Indianapolis, Indiana: Wiley, 2011, xxvi, 358. ISBN 9780470944882.
  • Making sense of data IIIa practical guide to designing interactive data visualizations. Edited by Glenn J. Myatt - Wayne P. Johnson. Hoboken, N.J.: Wiley, 2012, xiii, 384. ISBN 9781118121580.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.