Závěrečná práce: Karen Pailozian: Predikce teploty tání proteinů na základě strojového učení pro objevování stabilních biokatalyzátorů
Bakalářská práce
Predikce teploty tání proteinů na základě strojového učení pro objevování stabilních biokatalyzátorů
Machine learning-based prediction of protein melting temperatures for discovery of stable biocatalysts
Anotace
Stabilita proteinů je důležitou vlastností ovlivňující fungování biokatalyzátorů. Stabilní biokatalyzátory mohou zvýšit účinnost reakcí a najít uplatnění v průmyslu místo chemických katalyzátorů. V poslední době se k určování stabilních proteinů na základě jejich aminokyselinových sekvencí aktivně používají techniky strojového učení. Protože bod tání bílkovin silně koreluje se stabilitou, je to jedna …více
Abstract
Protein stability is an important property affecting the functioning of biocatalysts. Stable biocatalysts can improve reaction efficiency and find applications in industry instead of chemical catalysts. Recently, machine learning techniques have been actively deployed to determine stable proteins based on their amino acid sequences. As protein melting point strongly correlates with stability, it is …více
Zadání práce
Despite recent progress in high-throughput protein characterization, protein databases remain largely unannotated, presenting ample opportunities for discovering promising biocatalysts. One of their major desired properties is high protein stability [1,2]. However, the complexity of the mechanisms governing protein stability makes its prediction still an unresolved problem. Due to the growing amount of experimental data, the recent progress in tackling this problem is based on machine learning methods [3].
This project aims to extract the available data from the literature, replicate the protocol in [3], and build upon it by using more advanced feature-generating tools and a more comprehensive range of machine learning methods. The practical part of the thesis will be based on using the Python environment and scikit-learn library.
22. 5. 2023 09:11, Stanislav Mazurenko, PhD, učo 235907
Oponent
Citace dle normy ČSN ISO 690
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Testování mapovacího nástroje využívajícího umělou inteligenci a jeho využití pro humanitární mapování
Mgr. Jan Horák -
Projekt fAIr - služba pro vytváření AI modelů pro zjišťování objektů na leteckých snímcích pro potřeby tvorby OpenStreetMap
Bc. Hugo Krotil -
Využití umělé inteligence ve výuce zeměpisu
Mgr. Kristýna Michalcová -
Retrospektivní analýza ziskovosti sportovního sázení s využitím strojového učení
Mgr. Jan Pařízek -
Autorskoprávní aspekty zapamatování tréninkových dat ve strojovém učení
Mgr. Petr Kučera, LL.M. -
Gradientní boosting rozhodovacích stromů
Bc. Oskar Klíma, učo 503185 -
Reflexe etických a právních principů při vývoji a nasazení informačních technologií založených na strojovém učení
JUDr. Bc. Jakub Jeřábek, LL.M., učo 210115 -
Premediation & Xeno-Patterning: Imagining the World Without Us through Deep and Machine Learning
Dustin Skye Breitling, Ph.D.




