Diplomová práce

Charakterizace proteinů asociovaných s telomerami a telomerázou

Characterisation of telomere- and telomerase-associated proteins

Bc. Alžbeta Kusová
Anotace

Teloméry sú špecializované štruktúry nachádzajúce sa na koncoch eukaryotických chromozómov. Na udržiavaní ich dĺžky, ktorá je dôležitá pre ochranu koncov lineárnych chromozómov, sa podieľa enzým telomeráza – reverzná transkriptáza. Tento enzým je tvorený dvomi hlavnými podjednotkami: telomerázovou RNA nesúcou templát (TR) a telomerázovou reverznou transkriptázou (TERT). Samotnú telomerázu však netvoria …více

Abstract

Telomeres are specialized structures at the end of eukaryotic chromosomes. The enzyme telomerase – reverse transcriptase, is involved in maintaining their length, which is important for protecting the ends of linear chromosomes. It consists of two major subunits: telomerase RNA carrying a template (TR) and telomerase reverse transcriptase (TERT). However, telomerase itself does not consist of only …více

Zadání práce
Telomery jsou nukleoproteinové komplexy chránící fyzické konce lineárních chromozomů u živočichů stejně jako u rostlin. Telomerická DNA je asociována s celou řadou proteinů, které se podílejí na její ochraně, modifikaci či jejím prodlužování. Enzym prodlužující telomery, které se zkracují v každém buněčném cyklu, se nazývá telomeráza. V naší laboratoři byly izolovány a charakterizovány některé proteiny asociované s telomerickou DNA či se podílející se na regulaci délky telomer (Schrumpfova, Kuchar et al. 2004; Mozgova, Schrumpfova et al. 2008; Schrumpfova, Vychodilova et al. 2014). Některé z těchto proteinů jsou taktéž či asociované s telomerázou, podílejí se na jejím skládání a mohou regulovat její telomerázovou aktivitu (Schrumpfova, Vychodilova et al. 2014; Prochazkova Schrumpfova, Schorova et al. 2016; Majerská, Schrumpfová et al., 2017; Schorova, Fajkus et al., submitted). Některé vzájemné protein-proteinové interakce kandidátních proteinů, které se podílejí na skládání a přístupu telomerázy k telomerám či regulaci telomerické délky, jsou však stále předmětem intenzivního výzkumu. Cílem diplomové práce studentky bude charakterizace vzájemných interakcí proteinů zapojených do regulace délky telomer či proteinů ovlivňujících aktivitu telomerázy.
Práce zkontrolována:
15. 8. 2020 12:10, doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
Plný text práce
2,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
8. 9. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
NCBR PřF MU

Oponent

Ing. Blanka Pekárová, Ph.D., učo 236500
FGPR MCGPR CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Šárka Schořová, Ph.D.
NCBR PřF MU

Literatura

  • MOZGOVÁ, Iva; Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ; Ctirad HOFR a Jiří FAJKUS. Functional characterization of domains in AtTRB1, a putative telomere-binding protein in Arabidopsis thaliana. Phytochemistry. England: Pergamon-Elsevier Science Ltd, 2008, roč. 69, č. 9, s. 1814-1819. ISSN 0031-9422.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Milan KUCHAŘ; Jan PALEČEK a Jiří FAJKUS. Mapping of interaction domains of putative telomere-binding proteins AtTRB1 and AtPOT1b from Arabidopsis thaliana. FEBS LETT. Netherlands: Elsevier Science BV, 2008, roč. 582, č. 10, s. 1400-1406. ISSN 0014-5793.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Ivona VYCHODILOVÁ; Martina DVOŘÁČKOVÁ; Jana MAJERSKÁ; Ladislav DOKLÁDAL; Šárka SCHOŘOVÁ a Jiří FAJKUS. Telomere repeat binding proteins are functional components of Arabidopsis telomeres and interact with telomerase. The Plant Journal. Hoboken (USA): Blackwell Science, 2014, roč. 77, č. 5, s. 770-781. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/tpj.12428.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Šárka SCHOŘOVÁ a Jiří FAJKUS. Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell. Frontiers in Plant Science. Lausanne: Frontiers Media SA, 2016, roč. 7, June, s. nestránkováno, 19 s. ISSN 1664-462X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fpls.2016.00851.
  • MAJERSKÁ, Jana; Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ; Ladislav DOKLADAL; Šárka SCHOŘOVÁ; Karel STEJSKAL; Michal OBOŘIL; David HONYS; Lucie KOZÁKOVÁ; Pavla SOVÁKOVÁ a Eva SYKOROVA. Tandem affinity purification of AtTERT reveals putative interaction partners of plant telomerase in vivo. Protoplasma. Wien: Springer-Verlag, 2017, roč. 254, č. 4, s. 1547-1562. ISSN 0033-183X. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00709-016-1042-3.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.