Simulácie molekulovej dynamiky (MD) sú pre moderné vedy o živej
prírode (life sciences) kľúčové, najmä v oblasti návrhu liečiv
a modelovania vírusov, čo sa potvrdilo aj počas pandémie
COVID-19. Táto oblasť však čelí výzve týkajúcej sa správy dát.
Cenné súbory dát trajektórií často nie sú systematicky
uchovávané, čo bráni reprodukovateľnosti a budúcim
metaanalýzam. V dôsledku toho vyvstáva potreba repozitárov,
ktoré dodržiavajú princípy FAIR (nájditeľnosť, prístupnosť,
interoperabilita a opätovná použiteľnosť).

Táto práca rieši uvedený problém návrhom a vývojom
používateľského rozhrania pre dátový repozitár molekulovej
dynamiky. Hlavným cieľom bolo vytvoriť modernú webovú
aplikáciu, ktorá odstraňuje byrokratickú záťaž a pomáha
výskumníkom pri ich každodennej práci. Používateľské rozhranie
bolo navrhnuté v nástroji Figma a následne implementované.
Kľúčovými výsledkami práce sú domovská stránka prioritizujúca
vyhľadávanie (tzv. "search-first"), zoznam záznamov a správa
komunít pre efektívne objavovanie dát, ako aj viackrokový
sprievodca ukladaním, ktorý zjednodušuje proces zadávania
metadát. Aplikácia bola navyše kontajnerizovaná pomocou
technológie Docker a nasadená ako funkčný prototyp na cloudovej
infraštruktúre e-INFRA CZ. Táto práca v konečnom dôsledku
prispieva k širšej iniciatíve budovania infraštruktúry na
zdieľanie simulačných dát.