Diplomová práce

Strukturní a funkční charakterizace vybraných variant halogenalkandehalogenas

Structural and functional characterization of selected haloalkane dehalogenase variants

Bc. Klára Marková
Anotace

Enzymy jsou biologické katalyzátory, které urychlují chemické reakce. Nacházejí velké uplatnění při různých biotechnologických aplikacích, ty jsou však omezeny schopností enzymu zůstat stabilní v drsných podmínkách, jako je extrémní pH, přítomnost organických rozpouštědel nebo vysoká teplota. K vylepšení teplotní stability se tak často požívají nástroje proteinového inženýrství. Halogenalkandehalogenasy …více

Abstract

Enzymes are biological catalysts which speed up chemical reactions. They are increasingly used in various biotechnological applications that are, however, restricted by enzyme´s ability to stay stable at harsh conditions such as extreme pH, presence of organic solvents or high temperature. Protein engineering strategies are therefore often applied to improve thermal stability. Haloalkane dehalogenases …více

Zadání práce
Enzymy jsou proteiny, které urychlují chemické reakce. Znalost jejich struktury vede k pochopení způsobu, kterým plní svoji funkci a také k možnostem jejich následné úpravy s cílem vylepšit jejich vlastnosti. Charakterizace nově izolovaných nebo modifikovaných enzymů často začíná ověřením jejich správného uspořádání a pokračuje analýzou jejich struktury a funkce. Studovanými enzymy v této práci budou vybrané varianty halogenalkandehalogenas. Halogenalkandehalogenasy (EC 3.8.1.5) jsou hydrolytické enzymy štěpící vazbu uhlík-halogen v širokém spektru halogenovaných alifatických uhlovodíků. Tyto enzymy mají vysoký aplikační potenciál v bioremediacích, v biosensorech k detekci škodlivých látek v životním prostředí, v biosyntézách na výrobu léčiv a agrochemikálií a v buněčném zobrazování. Cílem diplomové práce bude detailní strukturní a funkční analýza vybraných variant halogenalkandehalogenas konstruovaných s cílem vylepšit jejich aktivitu a stabilitu pro praktické aplikace. V průběhu řešení diplomové práce se student detailně seznámí s technikami laboratorní přípravy enzymů jako je rekombinantní exprese a purifikace (metaloafinitní chromatografie, iontově výměnná chromatografie a gelová filtrace); dále se strukturní charakterizací enzymů s využitím spektroskopie cirkulárního dichroismu a rentgenovou krystalografií a nakonec s metodami funkční charakterizace enzymů zahrnující měření aktivity, substrátové specifity a rovnovážné kinetiky. Diplomová práce bude zpracována v anglickém nebo českém jazyce.
Práce zkontrolována:
11. 5. 2018 08:18, doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D., učo 16143
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
13. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D., učo 16143
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D., učo 55204
CF BIC CSB CEITEC MU

Konzultant

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441
ÚEB Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.