AFM (atomic force microscope, mikroskopie na bázi atomových sil) je moderní technika umožňující zobrazování biomolekul v trojdimenzionálním uspořádání. Patří mezi řadu tzv. scanning probe microscopies, které studují vzorkem pomocí „osahávání“ miniaturním hrotem. Rozlišení je tak vysoké, že je možné takto „vidět“ i jednotlivé molekuly bílkvin nebo nukleových kyselin. Pokud se provede modifikace hrotu vhodnou biomolekulou (např. protilátka, avidin, …), je možné na studovaném povrchu nalézt komplementární interagující biomolekuly (antigen, biotin, …) a studovat detaily vznikajícího afinitního komplexu včetně sil potřebných k jeho roztržení. Bakalářská práce by měla shrnout základní informace o této technice na základě vlastní literární rešerše, lze také provést několik modelových AFM měření a vyzkoušet si zpracování získaných 3D obrazů.