Disertační práce

Base-modified DNA quadruplexes: Structure and Noncovalent Interactions

Mgr. Jan Novotný, učo 176003
Anotace

Hlavním tématem disertační práce je studium strukturně-dynamických vlastností nukleových kyselin pomocí metod výpočetní chemie. Pozornost je věnována zejména nekanonické formě DNA označované jako DNA kvadruplex (G-DNA), vyskytující se v telomerních či regulačních částech buněčného genomu. Práce se zabývá vedle standardních modelů guaninových kvadruplexů i analogy odvozenými ze struktury 3H-xantinu …více

Abstract

Main subject of this Ph.D. thesis is a study of structural and dynamical properties of nucleic acids by means of computational methods. The work is focused primarily on the quadruplex fold of DNA which represents a noncanonical motif occurring in telomeric and regulatory parts of the cell genome. In this work, in addition to natural guanine-based models we are investigating structures containing 3H …více

Klíčová slova
DNA kvadruplex xantin teorie funkcionálu hustoty molekulární dynamika výpočet a analýza formačních energií nekovalentní interakce. DNA quadruplex Xanthine Density Functional Theory Molecular Dynamics Calculation and Decomposition of the Energy of Formation Noncovalent Interactions.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 12. 2014 22:22, prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381
Plný text práce
8,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
14. 1. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381
NCBR PřF MU

Oponenti

prof. RNDr. Michal Otyepka, PhD.
Přírodovědecká fakulta UP, Olomouc
Dr. Célia Fonseca Guerra
VU University Amsterdam
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie (čtyřleté)
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.