Diplomová práce

Homologní modelování a virtuální screening potenciálních inhibitorů intelektinu

Homology modeling and virtual screening of potential inhibitors for intelectin

Bc. Veronika Horská
Anotace

Tato diplomová práce se věnuje homolognímu modelování, in silico testování a návrhu inhibitorů lidského intelektinu-1, jež hraje významnou roli v akutním astmatu Th2 typu. Intelektin-1 se dle nedávných studií jeví jako velice slibný terapeutický cíl, jelikož se s velkou pravděpodobností podílí na expresi cytokinů MCP-1 a MCP-3, které vedou k astmatickému záchvatu. Zároveň má schopnost zesíťování mucinů …více

Abstract

This diploma thesis is focused on homology modeling, in silico testing and design of inhibitors of the human intelectin-1, which plays a significant role in Th2 type acute asthma. According to recent studies intelectin-1 seems like a very promising therapeutic target, since it is most likely involved in cytokine expression of MCP-1 and MCP-3 which lead to an asthmatick attack. It has also the ability …více

Zadání práce
Diplomová práce bude zaměřena na homologní modelování lidského intelektinu a následné využití tohoto modelu k virtuálnímu prohledávání nízkomolekulárních látek za účelem inhibice intelektinu. Práce zahrnuje výpočetní metody v oblasti homologního modelování a jejich porovnání pro získání nejlepšího možného modelu k dalšímu využití. Za tímto účelem budou využity programy jak na internetovém rozhraní tak specifické programy k tomu určeny (ICM, MODELLER). Tato oblast bude také zahrnovat výpočetní metodiku (molekulová dynamika) na prohledávání energetického globálního minima daného modelu s cílem získání co nejpřesnějšího startovacího modelu pro virtuální screening. V oblasti virtuálního prohledávání bude vyžíván program ICM, s kterým se studentka detailně seznámí a bude mít možnost pracovat s velkým množstvím knihoven nízkomolekulárních látek (současně dostupné farmaceutické látky).
Práce zkontrolována:
18. 5. 2015 08:43, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
25. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D.

Konzultant

Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765
GaDe CSB CEITEC MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.