Diplomová práce

Charakterizace alternativních sekvenčních motivů v C-bohaté telomerní DNA

Characterization of alternative sequence variants in C-rich telomeric DNA

Bc. Daniel Krafčík
Anotace

Tato práce se zabývá studiem telomerních sekvencí DNA a sekundárních struktur DNA, které dané sekvence mohou vytvářet. Konkrétně se jedná o alternativní sekvence, které jsou pozorovány ve vyšší míře u ALT (alternativní prodlužování telomer) linie rakovinových buněk, které jsou dávány do kontrastu s kanonickým telomerním šest nukleotidovým opakujícím se segmentem v C-bohatém řetězci (TAACCC)n. Cílem …více

Abstract

This work is aimed on studying telomeric sequences of DNA and higher order secondary structures of DNA which may arise from them. Specifically, alternative sequences, found in higher extent in ALT (Alternative Lengthening of Telomeres) cancer cell lines, are studied and put in contrast to canonical telomeric six nucleotide repeating segment from C-rich telomeric strand (TAACCC)n. Main goal of this …více

Klíčová slova
DNA telomere ALT pathway i-motif tetraplex hairpin C-overhang telomera i-motiv vlásenka
Zadání práce
V rámci tohoto projektu bude student studovat struktury jednořetězcové DNA odpovídající 5‘-C bohatému telomernímu přesahu v lidských ALT buňkách pomocí UV/CD, native PAGE, NMR spektroskopie a single particle FRET. V teoretické části práce student provede literární rešerši na téma telomerických přesahů se zaměřením na mechanistické aspekty jejich vzniku, přirozené variability, funkce a jejich přirozených vazebných partnerů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2017 15:54, doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D., učo 8725
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
13. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D., učo 8725
NekGen CSB CEITEC MU

Oponent

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Fyzika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.