Závěrečná práce: Daniela Mozolová: Optimalizace alternativních přístupů exprese lidských isoforem karbonických anhydráz
Bakalářská práce
Optimalizace alternativních přístupů exprese lidských isoforem karbonických anhydráz
The optimization of alternative expression approaches of human isoforms of carbonic anhydrases
Anotace
Karbonické anhydrázy jsou fylogeneticky rozšířená skupina metaloenzymů, které katalyzují reverzibilní hydrataci oxidu uhličitého. Kromě regulace pH, se účastní metabolických drah uhlíku a bioenergetických procesů buňky. Aktivita některých lidských isoenzymů je také spojena s patologickými stavy. Lidské karbonické anhydrázy IX (hCAIX) a XII (hCAXII) jsou nadměrně exprimovány nádorovými buňkami, zabezpečují …více
Abstract
Carbonic anhydrases are a phylogenetically widespread family of metalloenzymes, that catalyze the reversible hydration of carbon dioxide. Aside from pH regulation, they participate in metabolic pathways of carbon and bioenergetics of the cell. The activity of certain human isoenzymes has been connected to pathological states. Human carbonic anhydrase IX (hCA IX) and XII (hCA XII) are overexpressed …více
Zadání práce
V lidském těle se nachází 15 isoforem karbonických anhydráz (CA), jejichž funkce je primárně udržení homeostatického pH buněk. Vybrané isoformy těchto zinečnatých metaloenzymů (především CA IX) jsou exprimovány nádorovými buňkami což přispívá k růstu tumorů a jejich metastázím. Proto se tyto isoformy karbonických anhydráz staly cílem pro návrh selektivních inhibitorů. Tato snaha je ale komplikovaná vysokou homologií lidských CA. Dalším problémem je exprese v E. coli v dostatečném množství vybraných CA, zvláště rekombinantní CA IX.
Tato bakalářská práce se proto zaměřuje na optimalizaci alternativních přístupů exprese vybraných lidských isoforem karbonických anhydráz pomocí cell-free a exprese v kvasinkách Pichia pastoris. Při tradiční expresi v E. coli tvoří některé CA inkluzní tělíska a namísto proteinu divokého typu je nutné pracovat se solubilní mutantní variantou. Studentka se seznámí s metodami exprese v kvasinkových médiích, expresního mechanismu cell-free a purifikací pomocí chromatografických metod u vybraných isoforem např. CA II, CA IX a CA XII. Charakterizace čistoty a identity vypurifikovaného proteinu bude ověřena pomocí SDS-PAGE, MALDI TOF MS a jejich správné sbalení pomocí dalších biofyzikálních metod např. cirkulární dichroismus, diferenční skenovací fluorimetrie a dynamickým rozptylem světla.
17. 5. 2024 06:55, doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
Konzultant
ÚChem Chem PřF MU
Citace dle normy ČSN ISO 690
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Vývoj separačního systému pro látky s potenciálem vázat se na receptor pro aromatické uhlovodíky
Mgr. Jana Padrtová, učo 506142 -
Cytoplazmatický fragment etylénového receptoru ETR1 – purifikace a charakterizace rekombinantního proteinu
Bc. Tereza Fojtíková -
Pull-down assay jako nástroj pro separaci a identifikaci environmentálních kontaminantů s potenciálem narušovat hormonální regulaci
Mgr. Jana Padrtová, učo 506142 -
Exprese CIDE proteinů podílejících se na ukládání lipidů
Bc. Veronika Vundrová -
Příprava a charakterizace C-terminální přijímačové domény etylénových receptorů ETR2 a EIN4
Mgr. Denisa Vallušová -
Klonování a exprese strukturních genů polyvalentního stafylokokového bakteriofága
Mgr. Monika Beinhauerová, Ph.D. -
Strukturní a funkční charakterizace katalytické domény CA IX
Mgr. Karin Ravaszová -
Purifikace a analýza mikrobiálních proteinů pomocí chromatografických a elektroforetických metod
Mgr. Radek Tesařík, Ph.D.




