Bakalářská práce

Optimalizace alternativních přístupů exprese lidských isoforem karbonických anhydráz

The optimization of alternative expression approaches of human isoforms of carbonic anhydrases

Daniela Mozolová
Anotace

Karbonické anhydrázy jsou fylogeneticky rozšířená skupina metaloenzymů, které katalyzují reverzibilní hydrataci oxidu uhličitého. Kromě regulace pH, se účastní metabolických drah uhlíku a bioenergetických procesů buňky. Aktivita některých lidských isoenzymů je také spojena s patologickými stavy. Lidské karbonické anhydrázy IX (hCAIX) a XII (hCAXII) jsou nadměrně exprimovány nádorovými buňkami, zabezpečují …více

Abstract

Carbonic anhydrases are a phylogenetically widespread family of metalloenzymes, that catalyze the reversible hydration of carbon dioxide. Aside from pH regulation, they participate in metabolic pathways of carbon and bioenergetics of the cell. The activity of certain human isoenzymes has been connected to pathological states. Human carbonic anhydrase IX (hCA IX) and XII (hCA XII) are overexpressed …více

Zadání práce

V lidském těle se nachází 15 isoforem karbonických anhydráz (CA), jejichž funkce je primárně udržení homeostatického pH buněk. Vybrané isoformy těchto zinečnatých metaloenzymů (především CA IX) jsou exprimovány nádorovými buňkami což přispívá k růstu tumorů a jejich metastázím. Proto se tyto isoformy karbonických anhydráz staly cílem pro návrh selektivních inhibitorů. Tato snaha je ale komplikovaná vysokou homologií lidských CA. Dalším problémem je exprese v E. coli v dostatečném množství vybraných CA, zvláště rekombinantní CA IX.   

Tato bakalářská práce se proto zaměřuje na optimalizaci alternativních přístupů exprese vybraných lidských isoforem karbonických anhydráz pomocí cell-free a exprese v kvasinkách Pichia pastoris. Při tradiční expresi v E. coli tvoří některé CA inkluzní tělíska a namísto proteinu divokého typu je nutné pracovat se solubilní mutantní variantou. Studentka se seznámí s metodami exprese v kvasinkových médiích, expresního mechanismu cell-free a purifikací pomocí chromatografických metod u vybraných isoforem např. CA II, CA IX a CA XII. Charakterizace čistoty a identity vypurifikovaného proteinu bude ověřena pomocí SDS-PAGE, MALDI TOF MS a jejich správné sbalení pomocí dalších biofyzikálních metod např. cirkulární dichroismus, diferenční skenovací fluorimetrie a dynamickým rozptylem světla. 

Práce zkontrolována:
17. 5. 2024 06:55, doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
Plný text práce
4,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
26. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
ÚChem Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Tomáš Brom, Ph.D., učo 436685
NCBR PřF MU

Konzultant

Mgr. Alena Hofrová, Ph.D.
ÚChem Chem PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.