Cílem práce je naimplementovat segmentační algoritmus založený na principu otevřených aktivních kontur [1,2] a experimentálně ověřit jeho možnosti na biomedicínských obrazových datech. Textová část práce musí obsahovat: stručný popis implementovaného přístupu, informace o vytvořené implementaci a její experimentální vyhodnocení zaměřené především na přesnost, rychlost a paměťovou náročnost výpočtu. Cílem praktické části je nejen samotná implementace v jazyce C++, ale také vytvoření doprovodné dokumentace a začlenění implementovaného algoritmu do knihovny i3dlib vyvíjené v Centru analýzy biomedicínského obrazu.

Literatura:

• [1] T. Xu, D. Vavylonis, X. Huang. 3D actin network centerline extraction with multiple active contours. Medical Image Analysis, 18(2):272–284, 2014.
• [2] H. Li, T. Shen, M. B. Smith, I. Fujiwara, D. Vavylonis, X. Huang. Automated actin filament segmentation, tracking and tip elongation measurements based on open active contour models. In Proceedings of the 6th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2009, 1302-1305.