Každou minutu vyprodukuje rostoucí buňka milióny molekul RNA. Část z nich je překládána do proteinové sekvence, zbytek se účastní řady různých pochodů v buňce. Správné fungování jednotlivých procesů a tím životaschopnost organismu je zajišťováno kontrolními mechanismy. Specializované molekulárními stroje vyhodnocují zda jednotlivé kroky při výrobě RNA probíhají zprávným způsobem. Nesplňuje-li meziprodukt či koncový produkt požadavky na kvalitu, je označen a následně degradován. Jedním ze základních komponent kontroly kvality RNA v jádře je polyadenylační komplex s názvem TRAMP4. Nejnovější studie naznačují, že TRAMP se účastní regulace, nebo je alespoň důležitý pro udržování řady různých pochodů v buňce. Kmeny Saccharomyces cerevisiae obsahující mutace v jednom či obou Trf4p a Trf5p vykazují defekty ve sporulaci, zvýšenou hladinu rekombinace DNA, poruchy v opravách DNA, defekty v kohezi sesterských chromatid, sníženou fitness, či zvýšenou akumulaci metabolitů. Cílem daného tématu PhD práce je objasnit princip fungování tohoto komplexu ve vztahu k vybraným buněčným pochodům. Řešitelé témat se zaměří na detailní analýzy aktivity, vazby na RNA a na proteiny TRAMP-u in vivo a in vitro. Témata budou zpracovávána pomocí genetických, biochemických molekulárně biologických a strukturně biologických přístupů. Toto PhD téma je vhodné pro studenty biochemie, biologie, či biofyziky jež mají zájem o studium biologických pochodů na molekulární úrovni. Téma je vysoce interdisciplinární a dává kandidátovi možnost se seznámit s moderními technikami molekulární biologie, biochemie a biofyziky. Absolventi programu se budou schopni uplatnit na prestižních zahraničních a domácích akademických pracovištích. Tento výzkumný projekt je podporován prestižními granty Wellcome Trust a EMBO. Podrobnější informace podá zájemcům školitel.