Diplomová práce

Bioinformatická a funkční charakterizace genu ARCTICA v Arabidopsis thaliana

Bioinformatical and functional characterisation of the ARCTICA gene in Arabidopsis thaliana

Bc. Pavlína Koščová
Anotace

Jasně definovaná a někdy polárně orientovaná lokalizace proteinů na určitých buněčných místech je u rostlin častou podmínkou jejich funkce spřaženou s globálním programem ontogeneze. Účelem této studie je charakterizovat, s podporou bioinformatických nástrojů, rodinu proteinů, označovaných jako ARCTICA, které se polárně projevují na plazmatické membráně buněk Arabidopsis thaliana. Jsou představeny …více

Abstract

Clearly defined and sometimes polar localization of proteins at distinct cells sites is often a prerequisite of their function in conducting the overall ontogenetic program of the plant. The purpose of this study is to characterise, with support of bioinformatic tools, a family of proteins, designated ARCTICA, showing a polar enrichment at the plasma membrane of Arabidopsis thaliana cells. We present …více

Zadání práce
ARCTICA (ARC) is a gene of unknown function in the model plant Arabidopsis thaliana. It is a putative interactor of the AURORA kinase and shows interesting asymmetric localization at the outer polar domain of root cells. The topic of the master thesis will be to obtain novel insights into the fucntion and developmental role of ARC. The candidate will perform a thorough bioinformatical analysis including phylogenetic analysis of the evolution of ARC family in higher plants; sequence scanning for potential functional domains; protein topology and structure predictions; in silico co-expression analysis. In paralel, approaches of molecular biology and molecular genetics in combination with phenotype analysis and microscopy will be used to gain insight into loss- and gain-of-function effects of ARC and into subcellular localization and dynamics.
Práce zkontrolována:
2. 6. 2014 15:23, Mgr. Jiří Friml, Dr. rer. nat., učo 7081
Plný text práce
54,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
19. 6. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jiří Friml, Dr. rer. nat., učo 7081
abs PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

Tomasz Nodzynski, B.A., M.Sc., Ph.D., učo 119287
ext NCBR PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.