Bakalářská práce

Analýza vazebné diverzity proteinů s doménou podobnou Myb doméně

Analysis of binding diversity of Myb-like proteins

Matúš Grieš
Anotace

Proteiny s doménou podobnou Myb doméně (Myb-like) jsou základními složkami telomerického chromatinu a jsou schopny rozpoznávat a vázat telomerickou DNA. Ačkoli je strukturální konzervovanost jejich Myb-like domén dobře známa, míra jejich sekvenční vazebné specifity napříč rostlinnými liniemi zůstává nevyřešena. V této studii jsme exprimovali a purifikovali Myb-like domény proteinů TRB1 z Arabidopsis …více

Abstract

Myb-like proteins are essential components of telomeric chromatin, capable of recognizing and binding telomeric DNA through their conserved Myb-like domain. Although their structural conservation is well established, the extent of their sequencebinding specificity across plant lineages remains unresolved. In this study, we expressed and purified Myb-like domains from TRB1 proteins of Arabidopsis thaliana …více

Klíčová slova
Myb-like doména proteiny vážící telomerické repetice EMSA purifikace proteinů exprese proteinů rostlinné telomery Myb-like domain telomere repeat-binding proteins protein purification protein expression plant telomeres
Zadání práce
Telomerické sekvence jsou krátké sekvence nukleotidů, které se nacházejí jak na koncích lineárních chromozomů, tak v promotorech mnoha genů. Přestože jsou telomerické repetice u různých skupin organismů vysoce konzervované, telomerická kánonická sekvence může být u některých organismů nahrazena i alternativními sekvencemi. Navzdory variabilitě mezi organismy jsou tyto repetice rozpoznávány proteiny s Myb-like doménou typu telobox. Tato doména je evolučně vysoce konzervovaná. I když bylo prokázáno, že proteiny s Myb-like doménou typu telobox dokáží vázat různé kánonické telomerické sekvence, detailní charakterizace této vazebné diverzity u rostlin zatím chybí. Cílem této bakalářské práce bude analýza vazby proteinů s Myb-like doménou typu telobox na DNA. Bakalářská práce bude experimentální.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2025 08:43, doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
Plný text práce
2,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
12. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868
CF BIC CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Molekulární biologie a genetika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.