Karcinom jícnu (EC) je světově osmým nejčastějším nádorovým onemocněním s nepříznivou prognózou, vysokou agresivitou onemocnění a vysokou mortalitou. Časný záchyt onemocnění zvyšuje šance pacientů na přežití, avšak více než 70% pacientů je zejména z důvodu chudé symptomatologie diagnostikováno v pokročilém stadiu. Lokálně pokročilé onemocnění vyžaduje komplexní onkologickou terapii s následným operačním řešením a případnou adjuvantní imunoterapií. Řada pacientů nicméně vykazuje nízkou odezvu nebo jsou na imunoterapeutickou léčbu zcela rezistentní. Peptidom představuje oblast s velkým potenciálem pro aplikaci nové diagnostické metody a zisk nových biomarkerů. S využitím metody Laserové desorpce/ionizace za účasti matrice s hmotnostně spektrometrickou detekcí (MALDI MS) byly identifikovány potenciální biomarkery pro EC. Použití metody MALDI MS pro diagnostické účely je v současné době stále populárnější zejména díky robustnosti, reprodukovatelnosti dat, komplexitě, časové a finanční nenáročnosti a vysoké citlivosti této metody. Na základě současných poznatků lze očekávat její přínos pro sledování pacientů v období remise a dále také k predikci odpovědi pacientů s EC na zvolenou terapii (zejména imunoterapii), tedy využití metodiky jako preselekce před použitím standardních vyšetřovacích metod. Cílem projektu je vyvinutí metody pro (a) rutinní sledování pacientů ve fázi dlouhodobé remise a jejich predispozice k relapsu onemocnění a (b) k identifikaci vhodných pacientů pro imunoterapeutickou léčbu. V rámci projektu bude analyzováno krevní sérum pacientů s EC, budou využity technologie MALDI MS, ELISA a RT-qPCR. Experimentální data budou vyhodnocována pomocí statistických modelů a strojového učení v jazyce R, přičemž budou korelována s klinickými údaji. Vyvinutá metoda by spolu s poznatky o molekulární biologii nádorového mikroprostředí mohla přispět ke zlepšení diagnostiky a časné identifikaci relapsu onemocnění.