Diplomová práce

Regulace fosforylace MAP2c pomocí GSK3 beta po aktivaci různými kinázami a vliv fosforylace na její interakce.

Regulation of MAP2c phosphorylation by GSK3 beta after priming by different kinases and effect of phosphorylation on its interactions.

Bc. Róbert Šándor, učo 499268
Anotace

Cytoskeletální proteiny asociované s mikrotubuly (MAPs) regulují stabilitu a dynamiku mikrotubulů. Uvnitř neuronů se výskyt různých MAPs liší. Tau, spojovaný s patologií Alzheimerovy choroby, je přítomen především v axonech, zatímco mikrotubuly-vázající protein 2 (MAP2) se nachází v buněčných tělech a dendritech. Tau i MAP2 jsou klasifikovány jako vnitřně neuspořádané proteiny (instrinsically disordered …více

Abstract

Cytoskeletal microtubule-associated proteins (MAPs), regulate the stability and dynamics of microtubules. Inside neurons, occurrence of various MAPs differs. Tau, associated with the pathology of Alzheimer’s disease is present mostly in axons, whereas microtubule-associated protein 2 (MAP2) is found in cell bodies and dendrites. Both Tau and MAP2 are classified as intrinsically disordered proteins …více

Zadání práce
Cytoskeletal microtubule-associated Proteins (MAPs) are proteins important for regulating the stability and dynamics of the microtubule. MAP2 and Tau are brain MAPs, MAP2 is localized in dendrites, whereas Tau is localized in axons. However, the localization of MAP2c and the assumed physiological roles of Tau and MAP2c differ. Both MAP2c and Tau are naturally disordered proteins that do not form stable three-dimensional structures. These two proteins are substrates of multiple kinases in vivo, which phosphorylate them at different Serine/Threonines. The phosphorylation of MAP2c and Tau regulates their binding to the microtubules and to different proteins important for neurons plasticity. We have previously expressed functional GSK3 kinase in our lab, and recorded the phosphorylation of MAP2c by NMR, revealing more than 10 phosphorylation sites on MAP2c. Possible phosphorylation sites were determined by mass spectrometry, and several phosphorylation sites were assigned, mainly in the C-terminal domain of MAP2c using NMR. The task of the student would be to complete the assignement of the residues phosphorylated by GSK, using MAP2c mutants where possible phosphorylation sites have been deleted, and NMR spectra used for assignment. The kinetics of phosphorylation of the different sites will then be determined. The student would also determine how phosphorylation by other kinases such as PKA or ERK2 could regulate the activity of GSK3. The second part of the thesis would be to determine how GSK3 may interfere with binding of MAP2c with interacting partners.
Práce zkontrolována:
17. 5. 2024 09:32, Séverine Jansen, PhD., učo 128288
Plný text práce
17,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
18. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Séverine Jansen, PhD., učo 128288
BNMRS CSB CEITEC MU

Oponent

Ing. Blanka Pekárová, Ph.D., učo 236500
MCGPR CEITEC MU

Konzultant

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
BNMRS CSB CEITEC MU

Literatura

  • MELKOVÁ, Kateřina; Vojtěch ZAPLETAL; Subhash NARASIMHAN; Séverine JANSEN; Jozef HRITZ; R. SKRABANA; M. ZWECKSTETTER; M. RINGKJOBING JENSEN; M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Structure and Functions of Microtubule Associated Proteins Tau and MAP2c: Similarities and Differences. Biomolecules. Basel, Switzerland: MDPI AG, 2019, roč. 9, č. 3, s. 105-136. ISSN 2218-273X. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/biom9030105.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.