Bakalářská práce

Exprese podjednotky delta bakteriálních RNA polymeras pro strukturní a vazebné studie

Expression of delta subunit of bacterial RNA polymerases for structural and binding studies

Michal Špičák
Anotace

Genetická informace uložená v DNA je přepisována do molekul RNA vícepodjednotkovým enzymem RNA polymerasou. RNA polymerasa zástupců bakteriálního kmene Firmicutes se skládá z katalytického jádra α2β β ’ω a dvou dalších podjednotek, δ a ε. δ podjednotka má velký vliv na expresi virulentních faktorů u důležitého lidského patogenu Staphylococcus aureus. V této bakalářské práci byla δ podjednotka druhu …více

Abstract

The genetic information stored in DNA is transcribed to molecules of RNA by the multisubunit enzyme RNA polymerase. RNA polymerase of bacterial phylum Firmicutes is composed of the catalytic core α2β β ’ω and two additional subunits, δ and ε. The δ subunit has a great impact on the expression of virulence factors in a major human patogen Staphylococcus aureus. In this thesis the δ subunit of S. aureus …více

Zadání práce

RNA polymerasa Gram-pozitivních bakterií obsahuje podjednotku delta, která není esenciální, ale umožňuje regulaci transkripce iniciačními nukleotidtrifosfáty. Předchozí studie v laboratoři vedoucího ukázaly, že pro funkci podjednotky delta je nezbytná správná konformační rovnováha její neuspořádané C-terminální domény, udržovaná elektrostatickými interakcemi kyselých postranních řetězů se shlukem lysinů. Důležitou výjimku tvoří podjednotky delta stafylokoků postrádající shluk lysinů.

Cílem bakalářské práce je exprimovat podjednotky delta a jejich mutanty za účelem srovnání struktury a funkce proteinů z bakterií Bacillus subtilis a Staphylococcus aureus. Úkolem studenta bude exprimovat a purifikovat podjednotky delta pro následující strukturní a vazebné studie. Během práce si student osvojí techniky exprese rekombinantních proteinů, chromatografické separace, metody zavedení stabilních isotopů pro strukturní studie pomocí NMR a seznámí se s úvodní fází strukturní analýzy proteinů.

Práce zkontrolována:
19. 5. 2023 05:52, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
Plný text práce
5,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
8. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Marek Šebesta, Ph.D., učo 107231
PRNA CSB CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Martin Černý, Ph.D., učo 451182
BNMRS CSB CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.