Závěrečná práce: Michal Špičák: Exprese podjednotky delta bakteriálních RNA polymeras pro strukturní a vazebné studie
Bakalářská práce
Exprese podjednotky delta bakteriálních RNA polymeras pro strukturní a vazebné studie
Expression of delta subunit of bacterial RNA polymerases for structural and binding studies
Anotace
Genetická informace uložená v DNA je přepisována do molekul RNA vícepodjednotkovým enzymem RNA polymerasou. RNA polymerasa zástupců bakteriálního kmene Firmicutes se skládá z katalytického jádra α2β β ’ω a dvou dalších podjednotek, δ a ε. δ podjednotka má velký vliv na expresi virulentních faktorů u důležitého lidského patogenu Staphylococcus aureus. V této bakalářské práci byla δ podjednotka druhu …více
Abstract
The genetic information stored in DNA is transcribed to molecules of RNA by the multisubunit enzyme RNA polymerase. RNA polymerase of bacterial phylum Firmicutes is composed of the catalytic core α2β β ’ω and two additional subunits, δ and ε. The δ subunit has a great impact on the expression of virulence factors in a major human patogen Staphylococcus aureus. In this thesis the δ subunit of S. aureus …více
Zadání práce
RNA polymerasa Gram-pozitivních bakterií obsahuje podjednotku delta, která není esenciální, ale umožňuje regulaci transkripce iniciačními nukleotidtrifosfáty. Předchozí studie v laboratoři vedoucího ukázaly, že pro funkci podjednotky delta je nezbytná správná konformační rovnováha její neuspořádané C-terminální domény, udržovaná elektrostatickými interakcemi kyselých postranních řetězů se shlukem lysinů. Důležitou výjimku tvoří podjednotky delta stafylokoků postrádající shluk lysinů.
Cílem bakalářské práce je exprimovat podjednotky delta a jejich mutanty za účelem srovnání struktury a funkce proteinů z bakterií Bacillus subtilis a Staphylococcus aureus. Úkolem studenta bude exprimovat a purifikovat podjednotky delta pro následující strukturní a vazebné studie. Během práce si student osvojí techniky exprese rekombinantních proteinů, chromatografické separace, metody zavedení stabilních isotopů pro strukturní studie pomocí NMR a seznámí se s úvodní fází strukturní analýzy proteinů.
19. 5. 2023 05:52, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
Konzultant
Citace dle normy ČSN ISO 690
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Purifikace a přiřazení NMR frekvencí N-terminální domény podjednotky delta RNA polymerasy bakterie Staphylococcus aureus
Mgr. Markéta Petrůjová -
Structure and dynamics of subunits determining specificity of bacterial RNA polymerase
Mgr. Milan Zachrdla, Ph.D. -
Computational and NMR characterization of intrinsically disordered protein regions
Mgr. Vojtěch Zapletal, Ph.D., učo 357261 -
NMR analýza strukturních vlastností lidského Tau proteinu
Mgr. Viliam Volko, učo 506166 -
Příprava delta podjednotky RNA polymerázy z bakterie Bacillus subtilis v orientujících médiích
Linda Chasák Kameníková -
Charakterizace minoritního stavu sigma podjednotky RNA polymerázy z bakterie Bacillus subtilis
Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988 -
Structure, dynamics and interactions of mycobacterial transcription factors
Mgr. Martin Černý, Ph.D., učo 451182 -
Analýza výskytu a přenos genu pro enterotoxin A u druhu Staphylococcus aureus
Mgr. Eva Šponerová




