Závěrečná práce: Vladimír Horský, učo 358970: Annotation of saccharide molecules
Bakalářská práce
Annotation of saccharide molecules
Anotace
Cukerné molekuly jsou klíčové komponenty v metabolismu živých buněk. Kvůli jejich důležitosti jsou často předmětem výzkumu a lze je nalézt v různých databázích, kde jejich počet stále roste. Cukry, obsažené ve zmíněných databázích, jsou často nesprávně pojmenovány. Cílem této práce bylo navrhnout a implementovat algoritmus pro správné pojmenování cukerných molekul. Nejdříve bylo nutné pochopit chemický …více
Abstract
Saccharide molecules serve as key parts of metabolism of living cells. Given their importance, saccharides are a frequent subject of research and can be found in various databases, where their quantity has rising tendency. Saccharides, contained in various databases, are often incorrectly annotated. The objective of this thesis was to design and implement algorithm for correct saccharide molecule annotation …více
Zadání práce
Existuje několik stovek chemicky různých molekul cukrů a v rámci biochemických databází jsou bohužel tyto molekuly často nesprávně pojmenovány. Tato bakalářská práce je zaměřena právě na návrh a vývoj algoritmů pro korektní anotaci názvů molekul cukrů. Konkrétní cíle práce jsou:
- Nastudovat základní chemické pojmy, související s 2D a 3D strukturou molekul cukrů
- Nastudovat způsob reprezentace molekul v počítači
- Navrhnout a implementovat algoritmus pro anotaci molekul cukrů s využitím správně anotovaných molekul z databáze Ligand Expo
- Otestovat vytvořený program na reálných molekulách cukrů
29. 5. 2012 14:16, prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
angličtina
Vedoucí
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Anotace a validace molekul ligandů
Mgr. Vladimír Horský, Ph.D., učo 358970 -
Searching and classification of biochemically important motives in proteins
Mgr. Petr Kovács, učo 99085 -
Algoritmy pro analýzu správnosti strukturních dat molekul cukrů
Mgr. Bc. Andrea Čechová, učo 255487 -
Linux client for YSoft SafeQ
Mgr. Dávid Kaya, učo 409878 -
Renderování 3D textu v OpenGL
Mgr. Adam Vaňko -
Analýza vazebných míst cukrů v proteinech
Mgr. Martin Nováček -
Replication of PDB validation server functionality in the MetaCentrum environment
Bc. Martin Jediný -
Algoritmická analýza struktury vazebných míst cukrů
Mgr. Lukáš Hanušovský
Složky
Soubory
-
Přidání souboru
Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat. -
Další operace se soubory
Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku. -
Pohled pro experty
Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností. -
Vyhledávání souborů
Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku. -
Rychlý přístup k souborům
Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.