Kalusy, pluripotentní rostlinné kultury, představují ze své podstaty geneticky a epigeneticky nestabilní systém. V předešlé studii jsme ukázali prodlužování telomer během dlouhodobé propagace různých ekotypů modelové rostliny Arabidopsis thaliana v kalusové kultuře, a variabilní délky telomer v rostlinách z těchto kalusů regenerovaných po 10 – 24 měsících kultivace (Sováková et al., 2018). Posttranslační modifikace histonů se výrazně lišily mezi 20-denními kalusy a 7-denními klíčními rostlinami, ze kterých byly kalusy založené, i mezi kalusy, které byly založené z kořenové a listové části klíčních rostlin. K homogenizaci histonových značek v kalusech došlo až po jejich dlouhodobé kultivaci (Pírek et al., 2023).

V bakalářské práci budou popsány změny, ke kterým dochází během procesů transformace rostlinného pletiva v kalus. V experimentální části budou metodou TRF (terminal restriction fragments, Fojtová et al., 2015) analyzovány délky telomer během několikaměsíční kultivace kalusů založených z celých klíčních rostlin A. thaliana a z jejich listové a kořenové části.

Jelikož je propagace rostlin ve formě kultur či protoplastů součástí moderních biotechnologických postupů, včetně cílených editací genomů, je nutno dokonale pochopit všechny změny, které jsou s tímto procesem spojené.

Cíle práce

• Genetické a epigenetické změny doprovázající indukci kalusové kultury, nestabilita délek  telomer A. thaliana během dlouhodobé kultivace kalusů (Teoretická část).
• Založení kalusů z klíčních rostlin A. thaliana, a z jejich listové a kořenové části.
• Kultivace kalusů (6 měsíců), sběr materiálu při pasážování.
• Izolace DNA z klíčních rostlin a kalusů, analýza délek telomer metodou TRF