Bi7140 Molecular biology of viruses

Faculty of Science
Autumn 2005
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Type of Completion: zk (examination).
Teacher(s)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Department of Experimental Biology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Timetable
Wed 13:00–14:50 B1,01004
Prerequisites
B4030 Molecular biology || B5740 Molecular biology || B6130 Molecular biology || B7940 Molecular biology || B4020 Molecular biology || Bi4020 Molecular biology
1.Molecular structure reproduction a function of procaryotic and eucaryotic genome. 2. Basic methods in molecular biology 3. Molecular foundation of acquired immunity. Molecular foundation of cancerogenesis.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 6 fields of study the course is directly associated with, display
Abstract
Molecular biology and genetics of bacterial viruses contains morphology and structure of bacterial viruses, infection and lysis of bacterial cells caused by phage virions, adsorption of phage virion to the surface of bacterial cells, synthesis of bacterial viruses in host cell, mutation and recombination of bacteriophage, lysogeny and genetics of temperate phage, general characteristics of some temperate phages. Molecular biology and genetics of vertebrate and invertebrate viruses: papovaviruses, adenoviruses, herpesviruses, poxviruses, parvoviruses, reoviruses, flaviviruses, picornaviruses, togaviruses, arteriviruses, rhabdoviruses, paramyxoviruses, filoviruses, orthomyxoviruses, bunyaviruses, retroviruses, hepadnaviruses. Molecular biology of retroviruses including the virus HIV and HTLV, adenoviruses, herpesviruses, influenzavirus, hepadnaviruses and oncoviruses are given in detail. Molecular biology and genetics of plant viruses: caulimoviruses, geminiviruses, bromoviruses, nepoviruses, tymoviruses, tobamoviruses, tombusviruses, luteoviruses, hordeiviruses, potexviruses etc. Characteristics of main types of plant diseases caused by viruses are explained. Molecular taxonomy and evolution of viruses. Molecular diagnostic of viruses. Prions and viriods. Virus cloning vectors.
Key topics
1. Molecular characterisation of live noncellular systems, termines a definition explaining the nature molecular biology of viruses 2. Properties of viruses having importance in their molecular classification 3. Life cycle of viruses and the types of viral infections in host organisms, molecular mechnisms of viral persistence and latency 4. Molecular characteristic of viruses of procarytes 5. Molecular characteristic of viruses of ecaryotes i.e. vertebrates, invertebrates, and plants. 6. Molecular characteristic of oncoviruses 7. Molecular basis of occurence of transmissible encephalopathy (TSE) 8. Molecular diagnostics and evolution of viruses.
Study resources and literature
  • Přehled literatury je dostupný u vyučujícího
  • ROSYPAL, Stanislav. Úvod do molekulární biologie. Díl druhý, (Makromolekulární biologie eukaryot). 3. inovované vyd. Brno: Stanislav Rosypal, 1999, s. 304-600. ISBN 80-902562-1-X. info
  • Špeciálna virológia. Edited by Jaroslav Žemla - Fedor Čiampor - Milan Labuda. 1. vyd. Bratislava: Slovac Academic Press, 1998, 226 s., č. ISBN 80-88908-04-3. info
  • TIMBURY, Morag C. Notes on medical virology. 11th ed. New York: Churchill Livingstone, 1997, 196 s. ISBN 0-443-05846-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Úvod do molekulární biologie : dodatek. 2. rozš. vyd. Brno: Stanislav Rosypal, 1997, 996 s. info
  • Všeobecná virológia. Edited by Jaroslav Žemla - Fedor Čiampor - Jozef Leššo. 1. vyd. Bratislava: Slovac Academic Press, 1995, 238 s., il. ISBN 80-85665-47-6. info
  • LEVY, Jay A.; Heinz FRAENKEL-CONRAT and Robert A. OWENS. Virology. 3rd ed. Englewood Cliffs: Prentice-Hall, 1994, xii, 447 s. ISBN 0-13-953753-8. info
  • CANN, Alan J. Principles of molecular virology. London: Academic Press, 1993, 234 s. ISBN 0-12-158531-X. info
Method of verifying learning outcomes and course completion requirements (in Czech)
Výuka: přednáška, Zkouška: písemná: testové otázky, grafika, výpočty, doplňování a odpovědi.
Language of instruction
Czech
Follow-Up Courses
Teacher's information
http://orion.sci.muni.cz/kgmb/Student/7140.htm
Požadavky na úspěšné ukončení předmětu: 1. Porozumění základním principům a pojmům vystihujících molekulární podstatu parazitického způsobu existence virů v hostitelském systému (charakterizovat strukturní a funkční složky virového genomu, a vymezit jejich roli v procesech replikace, transkripce a translace u jednotlivých rodů a druhů virů) 2. Znalost mechanizmů tvorby produktů virové pozitivní RNA, negativní RNA, negativní RNA dvojího smyslu s uvedením příkladů virů s tímto mechanizmem 3. Znalost a interpretace základních molekulárních strategií replikace a exprese virových genomů tvořených dsDNA (s cyklicky permutovanými a nepermutovanými geny), ssDNA, dsRNA, +ssRNA, segmentované a nesegmentované -ssRNA, +ssRNA se zpětnou transkriptázou, dsDNA se zpětnou transkriptázou, detailněji u adenovirů, papovavirů, herpesvirů, poxvirů, parvovirů, reovirů, pikornavirů, togavirů, flavivirů, arterivirů, filovirů, rabdovirů, viru chřipky A, arenavirů, bunyavirů, viru HIV, viru HBV, kaulimovirů, geminivirů, viru mozaiky tabáku, viroidů a satelitů. 4. Vysvětlit molekulární podstatu procesu navození lyzogenního stavu a lýze bakteriofágem lambda. 5. Znalost vztahu viru s hostitelem, mutace (sus a ts) a rekombinace fágového genomu, mapování genomu, komplementace a interference, genetické mapy u vybraných virů. 6. Patogeneza virů jako výsledek interakce viru s hostitelem 7. Funkce virových transaktivátorů 8. Interpretace odlišností v mechanizmu zpětné transkripce u RNA virů a DNA virů. 9. Znalosti exprese virových genomů v prostředí jednobuněčných a mnohobuněčných organizmů v rozmezí hostitele v závislosti na druhu/ kmeni viru. 10. Porozumění vlivu virových proteinů na signální dráhy a na buněčnou apoptózu. 11. Znalosti antiterminace, změn genetické informace a evoluce u virů 12. Vymezení role virů (virových proteinů) v kancerogenezi 8. Základní znalosti o problematice onemocnění způsobených nekonvenčními infekčními agens priony 13. Přehled molekulární taxonomie a diagnostiky virů prokaryot, obratlovců, bezobratlých a rostlin. 14. Charakteristika a funkce virových vektorů odvozených od bakteriofága lambda. Písemná zkouška je koncipována tak, aby prostřednictvím asi 25 otázek ověřila rozsah znalostí z přednášené látky a míru pochopení základních principů a mechanizmů v molekulární biologii virů.
Further comments (probably available only in Czech)
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught annually.
The course is also listed under the following terms Autumn 2007 - for the purpose of the accreditation, Autumn 2010 - only for the accreditation, Autumn 2002, Autumn 2003, Autumn 2004, Autumn 2006, Autumn 2007, Autumn 2008, Autumn 2009, Autumn 2010, Autumn 2011, Autumn 2011 - acreditation, Autumn 2012, Autumn 2013, Autumn 2014, Autumn 2015, Autumn 2016, autumn 2017, Autumn 2018, Autumn 2019, Autumn 2020, autumn 2021, Autumn 2022, Autumn 2023, Autumn 2024, Autumn 2025, Autumn 2026.
  • Enrolment Statistics (Autumn 2005, recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2005/Bi7140