Bi3131 Bioinformatické exkurze

Přírodovědecká fakulta
podzim 2026
Rozsah
4 dny. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
Ing. Miloš Musil (přednášející)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (cvičící)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Miloš Musil
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 50 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/50, pouze zareg.: 17/50, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/50
Anotace

Předmět je určen posluchačům, kteří se chtějí seznámit s procesem zpracování, analýzy a interpretace rozsáhlých biologických dat v akademickém i komerčním prostředí a s využitím bioinformatických nástrojů a algoritmů v praktickém nasazení. Studenti nahlédnou do celého cyklu získání nových poznatků: od primárního sekvenování a proteomického profilování přes návrh algoritmů a využití strojového učení až po finální predikci struktur a vývoj nových léčiv.

V rámci exkurzí studenti navštíví čtyři pracoviště dle aktuální domluvy, např. CEITEC, Thermo Fisher, MSD Czech Republic, GeneSpector, ...
Výstupy z učení
Absolventi předmětu budou schopni popsat, jak probíhá výzkum a vývoj v oblasti bioinformatiky a výpočetní biologie, a budou schopni uvést rozdíl mezi akademickým výzkumem a komerčním vývojem softwarových řešení. Budou schopni popsat technické aspekty zpracování rozsáhlých dat a nároky na výpočetní infrastrukturu. Budou schopni vysvětlit význam kontroly kvality dat a standardizace algoritmů pro zajištění reprodukovatelnosti výsledků. Budou schopni popsat, jak probíhá validace bioinformatických modelů a sledování přesnosti prediktivních nástrojů při vývoji nových léčiv a v personalizované medicíně.
Klíčová témata
CEITEC - https://www.ceitec.eu/ • Thermo Fisher Scientific - https://www.thermofisher.com/cz/en/home.html • MSD Czech Republic - https://www.msd.cz/cs/ • GeneSpector s.r.o. - https://genespector.com/
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
praktická exkurze
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
účast na exkurzích a zpracování eseje popisující navštívená pracoviště (rozsah A4)
Navazující předměty
Odkaz a informace vyučujících
Výuka Bioinformatických exkurzí probíhá ve formě čtyř exkurzí organizovaných v únoru 2026 (termín bude upřesněn na začátku semestru). Bližší informace k organizaci exkurzí budou vystaveny v interaktivní osnově.


Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět se doporučuje zapsat v 1. nebo 3. semestru magisterského studia.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2026/Bi3131