PřF:C1171 Bioinformatická statistika II - Informace o předmětu
C1171 Aplikovaná statistika pro bioinformatiky II
Přírodovědecká fakultapodzim 2026
- Rozsah
- 2/2. 5 kr. Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- Mgr. Veronika Horská, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- Mgr. Veronika Horská, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Znalost základních statistických pojmů na úrovni předmětu C1170: Aplikovaná statistika pro bioinformatiky I.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Bioinformatika (program PřF, N-BINF)
- Anotace
- Cílem předmětu je seznámit studenta s pojmy, principy a metodami statistického modelování a zajistit dostatečné procvičení těchto metod na reálných bioinformatických datech s využitím statistického softwaru R.
- Výstupy z učení
- Vybraná diskrétní a spojitá rozdělení a jejich vlastnosti
Vícerozměrné parametrické testy
Vícerozměrné neparametrické testy
Základy statistického modelování
Lineární modely
Zobecněné lineární modely modely
Lineární modely s korelacemi - Studijní zdroje a literatura
- povinná literatura
- PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat 1 - 1. díl. Zobecněné lineární modely v prostředí R. 2. přepracované vydání. Brno: Masarykova univerzita, 2020, 278 s. ISBN 978-80-210-9622-6. info
- SHAHBABA, Babak. Biostatistics with R : an introduction to statistics through biological data. Dordrecht: Springer, 2012, xvi, 352. ISBN 9781461413011. info
- PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. 1. vyd. Brno: Masarykova universita, 2012, 256 s. ISBN 978-80-210-5812-5. info
- Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
- Přednášky: 2 hodiny týdně; teoretické přednášky zaměřené na seznámení se se statistickými pojmy a metodami.
Cvičení: 2 hodiny týdně; praktická cvičení na počítači zaměřená na aplikaci statistických metod při analýze bioinformatických dat s využitím statistického softwaru R. - Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
- Podmínka pro přihlášení na zkoušku: průběžná semestrální práce spočívající v aktivní prezenční účasti na cvičeních (povoleny jsou 2 neomluvené absence); vypracování a odevzdání řešení domácích úkolů reflektujících látku probíranou na cvičeních.
Zkouška: závěrečná semestrální písemná práce (nutné získat alespoň 50 % bodů); prezentace výsledků statistické analýzy (cca 10 min), kterou student zpracovává buď na vlastních datech nebo na poskytnutých datech. - Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2026/C1171