V naší laboratoři se zabýváme studiem telomer a telomeras. Telomery jsou nukleoproteinové komplexy charakteristické pro konce eukaryotických chromosomů. Při replikaci chromosomu v běžné somatické buňce dochází klasicky ke zkracování telomer, přičemž při kritické délce telomer ztrácí buňka dělivou schopnost, je tak tedy limitována proliferační kapacita buňky. Této limitaci se přirozeně vyhýbají např. kmenové a embryonální buňky živočichů, buňky meristematických pletiv rostlin, ale také nádorové buňky, a to pomocí enzymu telomerasy, reverzní transkriptasy schopné prodlužovat telomery. Skutečnost, že 90% nádorových buněk vykazuje telomerasovou aktivitu, se stává významnou komplikací při léčbě nádorových onemocnění, což je jedním z hlavních důvodů pro současný intenzivní výzkum tohoto enzymu. Kromě telomerické funkce má proteinová podjednotka telomerasy řadu tzv. netelomerických funkcí, které se pro svůj biologický význam stávají rovněž předmětem zájmu. V bakalářské práci se bude studentka zabývat charakterizací protein-protein interakcí proteinové podjednotky telomerasy z modelového organismu Arabidopsis thaliana (AtTERT), s důrazem na interakce s ATP-dependentními DNA helikasami AtRuvBL1 a AtRuvBL2. Teoretickou část práce by měla představovat literární rešerše týkající se současných poznatků z oblasti biologie telomer a telomeras, zejména pak souvislostí s odpovědí na poškození DNA (DNA damane response) a roli RuvBL proteinů v tomto mechanismu. V praktické části pak studentka naklonuje vybrané proteiny s využitím systému Gateway a následně otestuje interakce těchto proteinů s AtTERT podjednotkou pomocí dostupných in vivo a in vitro metod (např. kvasinkový dvouhybridní test, bimolekulární fluorescenční komplementace, pull-down assay). Seznam odborné literatury: Lack of effect of RuvB-like proteins on DNA damage signaling activation. Gospodinov A, Anachkova B. Z Naturforsch C. 2010 The multifaceted proteins Reptin and Pontin as major players in cancer. Grigoletto A, Lestienne P, Rosenbaum J. Biochim Biophys Acta. 2011. Structural and functional insights into a dodecameric molecular machine - the RuvBL1/RuvBL2 complex. J Struct Biol. 2011. Telomerase and telomere-associated proteins: structural insights into mechanism and evolution. Lewis KA, Wuttke DS. Structure 2012. Regulation of telomerase activity and anti-apoptotic function by protein-protein interaction and phosphorylation. Haendeler J, Hoffmann J, Rahman S, Zeiher AM, Dimmeler S. FEBS Lett. 2003. Screening a cDNA library for protein-protein interactions directly in planta. Lee LY, Wu FH, Hsu CT, Shen SC, Yeh HY, Liao DC, Fang MJ, Liu NT, Yen YC, Dokládal L, Sykorová E, Gelvin SB, Lin CS. Plant Cell 2012. Telomerase structure function. Mason M, Schuller A, Skordalakes E. Curr Opin Struct Biol. 2011. Non-telomeric activities of telomerase. Majerská J, Sýkorová E, Fajkus J. Mol Biosyst. 2011. Structure-function relationships in telomerase genes. Sýkorová E, Fajkus J. Biol Cell. 2009. Metody molekulární biologie. Jan Šmarda, Jiří Dostál, Roman Pantůček, Vladislava Růžičková, Jana Kostíková. nakl. MU Brno. 2005.