Fyzické konce eukaryotických chromozomů jsou tvořeny nukleoproteinovými komplexy nazývanými telomery. Telomerická DNA je v každém kroku replikace zkrácena a dosažení kritické délky telomer může v běžné somatické buňce vést až k nestabilitám genomu. Enzym, který se podílí na prodlužování telomer se nazývá telomeráza. Tento enzym je reverzní transkriptázou, která se skládá ze dvou podjednotek-RNA templátové podjednotky (TR) a proteinové katalytické podjednotky (TERT). V poslední době se ukazuje, že telomeráza může v buňkách zastávat kromě telomerické funkce také celou řadu netelomerických funkcí: např. se podílí na regulaci genové exprese, apoptóze, reparaci poškozené DNA, signalizaci či regulaci buněčného cyklu. Je možné, že zapojení telomerázy do příslušné dráhy závisí nejen na její lokalizaci v rámci buňky, ale také na interakčních partnerech interagujících s jak proteinovou, tak RNA podjednotkou. V rámci této diplomové práce se bude studentka zabývat charakterizací protein-proteinových interakcí s katalytickou podjednotkou telomerázy z modelového organizmu Arabidopsis thaliana (AtTERT). V práci naváže nejen na své výsledky, které byly popsány v její bakalářské práci, ale do studia budou zahrnuty také nové kandidátní proteiny. Pro detailní analýzu protein-proteinových interakcí bude využito celé řady dostupných metod (např. bimolekulární fluorescenční komplementace, kvasinkový dvouhybridní test či pull-down assay). Seznam odborné literatury: Finding the end: recruitment of telomerase to telomeres. Nandakumar J. and Cech R.T., Mol.Cell Biology. 2013 Telomerase structure function. Mason M, Schuller A, Skordalakes E. Curr Opin Struct Biol. 2011. Non-telomeric activities of telomerase. Majerská J, Sýkorová E, Fajkus J. Mol Biosyst. 2011. Structure-function relationships in telomerase genes. Sýkorová E, Fajkus J. Biol Cell. 2009. Metody molekulární biologie. Jan Šmarda, Jiří Dostál, Roman Pantůček, Vladislava Růžičková, Jana Kostíková. nakl. MU Brno. 2005. Internal telomeric repeats and 'TCP domain' protein-binding sites co-operate to regulate gene expression in Arabidopsis thaliana cycling cells. Trémousaygue D, Garnier L, Bardet C, Dabos P, Hervé C, Lescure B. Plant J. 2003 Plant interstitial telomere motifs participate in the control of gene expression in root meristems. Tremousaygue, D.,Manevski, A.,Bardet, C.,Lescure, N.,Lescure, B. Plant J. 1999 The multifaceted proteins Reptin and Pontin as major players in cancer. Grigoletto A, Lestienne P, Rosenbaum J. Biochim Biophys Acta. 2011. Telomerase and telomere-associated proteins: structural insights into mechanism and evolution. Lewis KA, Wuttke DS. Structure 2012. Regulation of telomerase activity and anti-apoptotic function by protein-protein interaction and phosphorylation. Haendeler J, Hoffmann J, Rahman S, Zeiher AM, Dimmeler S. FEBS Lett. 2003. Screening a cDNA library for protein-protein interactions directly in planta. Lee LY, Wu FH, Hsu CT, Shen SC, Yeh HY, Liao DC, Fang MJ, Liu NT, Yen YC, Dokládal L, Sykorová E, Gelvin SB, Lin CS. Plant Cell 2012.