Diplomová práce

Vliv abnormální struktury genomu na interakce úseků DNA u leukémií

The impact of abnormal genome structure on DNA interactions in leukemia

Bc. Karolína Černovská, učo 484101
Anotace

Chronická lymfocytární leukémie (CLL) je nejběžnějším typem leukémie postihující dospělé v zemích Západního světa. Jedná se o onemocnění po klinické i genetické stránce velice heterogenní. U velké části pacientů se CLL projevuje indolentním průběhem, na druhé straně je však skupina pacientů, u nichž se již od okamžiku diagnózy projevuje agresivní onemocnění, související se špatnou prognózou a nutností …více

Abstract

Chronic lymphocytic leukaemia (CLL) is the most common type of leukaemia affecting adults in the Western world. It is clinically and genetically very heterogeneous. A large proportion of patients have an indolent course of CLL; on the other hand, there is a group of patients who have an aggressive disease with a poor prognosis and need for treatment already at the time of diagnosis. The worse clinical …více

Klíčová slova
3D organizace genomu abnormální struktura genomu strukturní varianty SVs Hi-C Micro-C chronická lymfocytární leukémie CLL komplexní karyotyp KK 3D genome organization abnormal genome structure structural variations chronic lymphocytic leukemia complex karyotype CK
Zadání práce
Moderní sekvenační technologie umožňují detailní vyhodnocení struktury genomu ve dvou i třech rozměrech – tedy jak sekvence DNA, tak interakcí vzdálených úseků DNA v důsledku jejího skládání, které jsou nezbytné pro regulaci genové exprese. To je zejména důležité pro studium patofyziologie závažných onemocnění, mezi něž patří také hematologické malignity. Cílem diplomové práce bude určit detailní strukturu genomu vybraných primárních leukemických vzorků pomocí sekvenování dlouhých molekul DNA a metody Hi-C. Náplní práce bude optimalizace postupů izolace DNA pro obě metody, vlastní příprava vzorků pro analýzy a vyhodnocení získaných dat. Očekávaným výstupem je přispění k pochopení změn v regulaci exprese genomu v důsledku vybraných chromosomálních abnormalit.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2023 17:12, Mgr. Karla Plevová, Ph.D., učo 106100
Plný text práce
3,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
8. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Karla Plevová, Ph.D., učo 106100
IHOK FN Bohunice LF MU

Oponent

Mgr. Eva Ondroušková, Ph.D.
abs PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Molekulární biologie a genetika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.