Závěrečná práce: Mgr. Jiří Wiesner: Studium acetylcholinesterasy metodami výpočetní chemie
Disertační práce
Studium acetylcholinesterasy metodami výpočetní chemie
Investigation of Acetylcholinesterase by the Means of Computational Chemistry
Anotace
Acetylcholinesterasa (EC 3.1.1.7) je dokonalý katalyzátor. Monomer tohoto enzymu je schopen hydrolyzovat přirozený substrát acetylcholin s rychlostí obratu výrazně převyšující 10 000 katalytických cyklů za sekundu. Už 80 let přitahuje tento enzym živý zájem výzkumníků z oblastí molekulární biologie, biochemie a lékařství. Nejvíce zkoumanými jevy jsou inhibice, katalytický mechanismus a reaktivace. …více
Abstract
Acetylcholinesterase (EC 3.1.1.7) is perfect catalyst. Single monomer of this enzyme hydrolyses the native substrate, acetylcholine, with a turnover rate by far exceeding 10,000 catalytic cycles per second. For about 80 years, this enzyme has drawn vivid interest of researchers from the fields of molecular biology, biochemistry and medicine. Inhibition, catalytic mechanism and reactivation of acetylcholinesterase …více
Klíčová slova
acetylcholinesterasa acetylcholinesteráza protein enzym kyselina glutamová pKa molekulová dynamika molekulová mechanika silové pole Amber termodynamická integrace volná Helmholtzova energie potenciál střední síly elektrostatické síly PMF TI MD acetylcholinesterase enzyme glutamic acid molecular dynamics molecular mechanics Amber force field thermodynamic integration Helmholtz free energy potential of mean force electrostatic forces25. 11. 2011 19:23, prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
Vedoucí
NCBR PřF MU
Oponenti
PřF UP Olomouc
ÚFB JU a ÚSBE AV ČR České Budějovice
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Studium vztahů mezi přístupovými cestami a aktivitou enzymů metodami molekulového modelování
Mgr. Ondřej Vávra, Ph.D., učo 393643 -
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Mgr. Daniel Jaroň -
Vliv substituce guanin-inosin na stabilitu kanonických DNA a RNA duplexů
RNDr. Miroslav Krepl, Ph.D., učo 324182 -
Studium komplexů proteinů metodami molekulového modelování
Mgr. Veronika Lásková -
Výpočty paramagnetických posunů inkluzních komplexů metaloléčiv pomocí struktur z MD simulací
Mgr. Jakub Jakubec -
Mechanické vlastnosti biomolekul
Mgr. Ivo Durník, Ph.D. -
Porovnání citlivosti biochemických markerů u suchozemských plžů a žížal
Mgr. Dana Fojtová -
Úloha strukturní dynamiky při rozpoznání histonového proteinu H3 dimerem HP1 a vhodnost silových polí pro popis jejich interakcí
RNDr. Mgr. Pavlína Pokorná, Ph.D.




