Závěrečná práce: Mgr. Antonín Pavelka: Development of geometrical methods for protein engineering and analysis of protein structures
Rigorózní práce
Development of geometrical methods for protein engineering and analysis of protein structures
Anotace
Proteiny získané z živých organismů mohou být metodami proteinového inženýrství upraveny pro praktické využití. Evolučně variabilní rezidua v aktivním místě nebo přístupových tunelech jsou atraktivním cílem pro návrh enzymů nových katalytických vlastností. Nynější přístupy k identifikaci těchto „hot spot“ reziduí vyžadují znalost mnoha bioinformatických nástrojů, zkušenosti s interpretací jejich výsledků …více
Abstract
Proteins from living organisms can be adapted by methods of protein engineering and used as molecular tools in practical applications. Evolutionary variable residues in active site or lining access tunnels are an attractive target for engineering of enzyme catalytic properties. Current approaches for identification of such protein engineering hot spot residues requires knowledge of many bioinformatics …více
Klíčová slova
tunnel Voronoi diagram protein enzyme structural bioinformatics protein engineering rational design activity substrate specificity enantioselectivity mutability evolutionary conservation evolutionary rate tunel Voroného diagram enzym strukturní bioinformatika proteinové inženýrství racionální design aktivita substrátová specificita enantioselektivita mutabilita evoluční konzervovanost evoluční rychlost23. 2. 2012 08:43, prof. Ing. Jiří Sochor, CSc.
Oponenti
ext NCBR PřF MU, VŠCHT v Praze
Citace dle normy ČSN ISO 690
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Bioinformatics tools for the analysis of macromolecular structures
RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D. -
Počítačové modelování enzymů
Mgr. Jan Brezovský, Ph.D. -
Bioinformatická analýza a design halogenalkandehalogenas
Mgr. Eva Šebestová, Ph.D., učo 40707 -
Vývoj programu HOTSPOTTER pro výběr „hot spot” pozic pro účely proteinového inženýrství
RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D. -
Inženýrství rozpustnosti proteinů
Mgr. Hana Faldynová, učo 484081 -
Izolace a konstrukce biokatalyzátorů pro enviromentální aplikace
Mgr. Táňa Koudeláková, Ph.D., učo 39790 -
Vývoj bioinformatických nástrojů a databází pro proteinové inženýrství
Mgr. Jan Dvorský, Ph.D. -
Vývoj inhibitorů dehalogenáz.
Mgr. Tomáš Buryška, Ph.D.




