Bakalářská práce
Získaná ocenění: Cena děkana FI za vynikající závěrečnou práci

Web atlas of intron-tagged proteins

Pavel Růžička
Anotace

Lokalizace proteinů má v buněčné biologii zásadní význam pro pochopení funkce a chování proteinů po perturbaci buňky. Ve Výzkumném centru pro molekulární medicínu Rakouské akademie věd (CeMM) byla vyvinuta nová metoda pro hromadné tagování proteinů pomocí fluorescence za účelem vyhodnocení lokalizace. Tato práce zaměřuje na návrh a vytvoření webového atlasu těchto tzv. intron-tagged proteinů, který …více

Abstract

Protein localization is fundamental in cell biology as a means of understanding protein function and behavior following perturbation. A new method for pooled protein tagging with fluorescence to evaluate localization has been developed at CeMM, the Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences. In cooperation, this thesis focuses on designing and building a web atlas of …více

Zadání práce
The goal of the thesis is to develop a web atlas of proteins - an interactive application for visualization of large amounts of annotated microscopy data. The webpage enables end users to search for their protein of interest and indicates its localization within human cells in a set of microscopy images. A key part of the solution is the design of cloud-based IT infrastructure and database that are connected to existing computational resources. Different subsets of the data are made accessible to external end users, who are allowed to submit additional metadata themselves.

The project will be carried out in partnership with CeMM, the Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences in Vienna.

Práce zkontrolována:
28. 12. 2022 17:19, prof. RNDr. Tomáš Pitner, Ph.D.
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
27. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Tomáš Pitner, Ph.D.
KPSK FI MU

Oponent

Dr. Stefan Kubicek
The Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Plán
Programování a vývoj aplikací
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.