Bakalářská práce

Vyhledávání vazebných míst cukrů v molekulách proteinů

Searching for binding sites of sugars in proteins

Zdeněk Beneš
Anotace

V současné době je dostupno velké množství informací ohledně struktur proteinů. Tyto látky často váží molekuly cukrů a vazebná místa těchto cukrů jsou významnými částmi proteinů. Proto je velmi užitečné mít k dispozici informace ohledně uvedených vazebných míst. Za tímto účelem jsem navrhl a implementoval software Sugars_Find, který je schopen vyhledat v rámci databáze Protein Data Bank všechna vazebná …více

Abstract

The goal of this bachelor thesis is to design and implement software which is able to locate the sugar binding sites in proteins.

Klíčová slova
proteiny cukry proteinové motivy data mining Protein Data Bank
Zadání práce
Molekuly proteinů (bílkovin) jsou stavebními látkami buněk většiny organismů a účastní se také mnoha chemických reakcí, které v živých organismech probíhají. Tyto molekuly jsou velmi rozsáhlé, ale pouze jejich malá část je biochemicky aktivní a přímo zasahuje do chemických reakcí. Právě takovýmito biochemicky významnými motivy jsou například vazebná místa cukrů. Pro biologa nebo biochemika je velmi užitečné mít informaci o takovýchto motivech. A právě vyhledávání vazebných míst cukrů je cílem této bakalářské práce. Konkrétní úkoly práce jsou:
  • Nastudovat relevantní pojmy z oblasti počítačového zpracování proteinů (zápis proteinu v databázi Protein DataBank, zápis struktury vazebných míst atd.).
  • Navrhnout a implementovat program pro vyhledávání molekul cukrů a jejich okolí.
  • Otestovat vytvořený software na velkých množinách molekul, získaných z Protein DataBank.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
31. 5. 2010 09:16, prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
Plný text práce
512,7 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
24. 6. 2010
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
CF BioData CSB CEITEC MU

Oponenti

Mgr. Petr Fibinger
Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Zdeněk Beneš FI B-IN PSK mgp1r/7
Beneš, Z.
24. 5. 2010
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Beneš, Z.
24. 5. 2010
Anotace česky annotation.txt
Beneš, Z.
24. 5. 2010
Klíčová slova keywords.txt
Beneš, Z.
24. 5. 2010
Posudek oponenta posudek_oponent_benes_zdenek.doc
Svobodová Vařeková, R.
18. 6. 2010
Text práce bak.pdf
Beneš, Z.
24. 5. 2010
Zdrojové kódy zdrojove_kody.rar
Beneš, Z.
24. 5. 2010

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.