Bakalářská práce

Počítačové nástroje pro predikci a analýzu sekvenčních a strukturních motivů nukleových kyselin

Computer tools for prediction and analysis of sequence and structural motifs of nucleic acids

Jan Sloboda
Anotace

Strukturní motivy jsou sekvence s potenciálem vytvářet sekundární struktury nukleových kyselin odlišné od typické pravotočivé dvoušroubovice za vzniku některé z alternativních struktur (kvadruplexy, křížové struktury, triplexy, Z-DNA, R-smyčky). Sekvenční motivy jsou zpravidla krátké konzervované sekvence s biologickou funkcí, spadají sem například vazebná místa transkripčních faktorů, nebo místa …více

Abstract

Structural motifs are sequences with the potential to change the secondary structure of nucleic acids from the typical double helix into one of the alternative secondary structures (quadruplexes, cruciform, triplexes, Z-DNA, R-loops). Sequential motifs are usually short, conserved sequences with a biological function, as an example they include transcription factor binding sites or splice sites. Other …více

Zadání práce
Úlohou této bakalářské práce je rešeršní práce o srovnání algoritmů a dostupných bioinformatických nástrojů pro analýzu nukleotidových sekvencí se zaměřením na strukturní motivy nukleových kyselin. Je vyžadována aktivní účast studenta při zpracování rešerše a využití metodických přístupů laboratoře.
Práce zkontrolována:
17. 5. 2022 08:20, prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D., učo 15548
Plný text práce
1023,3 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D., učo 15548
AnatÚ Teorie LF MU

Oponent

Mgr. Radovan Krejčíř, Ph.D.
abs PřF MU

Konzultant

Mgr. Natália Valková, Ph.D.
ÚEB Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.