Diplomová práce

Analysis of Privacy Risks Stemming from Sharing Whole Slide Images

Bc. Tomáš Bíl
Anotace

S rychlým rozvojem metod strojového učení jsou tyto metody často používány k analýze biologiského materiálu. Kvůli tomu, že lidská biologická data mohou být považována za citlivá z pohledu ochrany soukromí, vznikají podmínky, za kterých je možné sdílet tato data. Whole slide images vznikají naskenováním vzorku do snímku s vysokým rozlišením. Tato práce analyzuje možná rizika spojení whole slides images …více

Abstract

With the massive development of machine learning, it is often used to analyse biological material. Because of considering human biological data sensitive from a privacy protection perspective creates conditions under which it is possible to share biological data. Whole slide images are created by scanning a microscope slide into a high-resolution digital image. The thesis analyses the possible risks …více

Zadání práce
The goal of the work is to attempt different methods to analyze risks of linking attacks to privacy of patients donating histopathological samples and imaging for research purposes. The analysis of linkability of histopatological slide imaging, so call Whole Slide Imaging (WSI), will be assessed using methods based on whole WSI and will include hierarchy of different types of materials to patients. The hierarchy of material should consider at least identical slides scanned on different scanners, consecutive slides, and non-consecutive slides from the same tissue block. The student will describe state of the art of suitable methods for similarity search and will propose application of suitable methods of supervised and/or unsupervised learning. The methods will be applied to different sizes of datasets. The results will be evaluated with respect to the patient linkage risks. The work will be conducted in collaboration with Masaryk Memorial Cancer Institute and with Medical University Graz.
Práce zkontrolována:
16. 12. 2021 11:50, doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
1. 2. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
BSD DKSD ÚVT MU

Oponent

Dr. Heimo Müller
Medical University Graz

Konzultant

doc. RNDr. Tomáš Brázdil, Ph.D., MBA, učo 4074
KSUZD FI MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Plán
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.