Diplomová práce

Analysis of Whole Slide Imaging Anonymity

Bc. Jan Čech
Anotace

Techniky strojového učení jsou v posledních letech používány k analýze biologických dat. Protože biologická data, a zejména klinická data, jsou považována za citlivé údaje, vyvstává otázka, jakou právní ochranou opatřit sdílení dat mezi výzkumnými institucemi. Tato práce se zaměřuje na analyzování rizik identifikace nebo propojení s pacientem při sdílení obrazů ze speciálních skenerů umožňujících digitalizaci …více

Abstract

In recent years, machine learning techniques are being used for analyzing biological data. Since biological data, and especially medical data, are considered sensitive from a privacy protection perspective, this emerges a question on under what legal conditions is it possible to share them between research institutions. This thesis focuses on analyzing the risks of re-identifying or linking data when …více

Zadání práce
The goal of the work is to attempt different methods to analyze risks of linking attacks to privacy of patients donating histopathological samples and imaging for research purposes. The analysis of linkability of histopatological slide imaging, so call Whole Slide Imaging (WSI), will be assessed using methods based on tiles generated from WSIs and will include hierarchy of linking individual tiles to WSIs and WSIs to patients. The student will describe state of the art of clustering methods and will propose application of suitable methods of supervised and unsupervised learning. The methods will be applied to different sizes of datasets. The results will be evaluated with respect to the patient linkage risks. The work will be conducted in collaboration with Masaryk Memorial Cancer Institute.
Práce zkontrolována:
24. 5. 2021 07:17, doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
24. 6. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
BSD DKSD ÚVT MU

Oponent

Dr. Luca Pireddu
Center for Advanced Studies, Research and Development in Sardinia (CRS4)

Konzultant

doc. RNDr. Tomáš Brázdil, Ph.D., MBA, učo 4074
KSUZD FI MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.