Alternativa bakalářské práce: Sabira Bučan: KCNN4 - málo známý gen aktivovaný p53
Alternativa bakalářské práce
KCNN4 - málo známý gen aktivovaný p53
Non-canonical p53 target gene KCNN4
Anotace
Nádorový supresor p53, často označovaný jako „strážce genomu“, prostřednictvím rozsáhlé transkripční sítě koordinuje řadu signálních drah. Ačkoli již byly popsány desítky známých cílových genů p53, které zajišťují zastavení buněčného cyklu, senescenci, opravu DNA a apoptózu, mnoho konzervovaných genů přímo regulovaných p53 zůstává přehlíženo a málo prozkoumáno. Draslíkový kanál aktivovaný vápníkem …více
Abstract
Tumor suppressor protein p53—often called the "guardian of the genome"—regulates numerous signaling pathways through its extensive transcriptional network. While dozens of well-established p53 target genes involved in cell cycle arrest, senescence, DNA repair, and apoptosis have been characterized, many conserved, directly regulated genes remain unnoticed and understudied. The calcium-activated potassium …více
Zadání alternativy bakalářské práce
TP53 is the most intensely researched gene in human genome. Despite of decades of enormous effort, there are many unanswered questions and understudied fields the TP53 biology. TP53 gene encodes a remarkable transcription factor p53 which directly transactivates about one hundred of conserved “core response” genes involved in multiple tumor-suppressive programs including apoptosis cell cycle arrest, DNA repair, or senescence. However, there is a group of genes undoubtedly regulated by p53 with poorly defined role in carcinogenesis and cellular response to p53 activation. One of such understudied p53 targets is KCNN4, a potassium calcium-activated channel gene.
Rationale
Besides of several dozens of p53 target genes with well-defined function, many genes within this network represent a grey area of knowledge. Understanding better the role of those genes is required for elucidating tumor-suppressive mechanisms driven by p53. Importantly, as p53 activity is context-dependent with distinct characteristic influenced by differentiation, knowing more about p53 target genes is essential for defining roles of p53 across various tissues.
Hypothesis
KCNN4 is induced by p53 activity in colorectal carcinoma lines on the protein level.
Specific Aims
To test the hypothesis, we will pursuit following Specific Aims:
Aim 1. To identify p53 RE in the KCNN4 locus.
Aim 2. To verify KCNN4 induction on protein level by western blot.
Aim 3. To validate KCNN4 antibody specificity by KCNN4 suppression by shRNA.
Upozornění:
Závěrečná práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 14. 5. 2035.
Odůvodnění: Zveřejnění Závěrečného projektu je odloženo do 14.5.2035.
Vedoucí
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Bakterie a nádory
Mgr. Eva Šviráková -
Střevní mikrobiom a kolorektální karcinom
Mgr. Natálie Kazdová -
Molekulární interakce onkogenu Mdm2 v nádorových buňkách
Mgr. Kateřina Kučerová, Ph.D., učo 269355 -
Status selenu v krevním séru pacientů s kolorektálním karcinomem
Mgr. Kateřina Guziurová -
Vliv těžkých kovů na sekvenčně specifickou vazbu proteinů p63 a p73 k DNA
RNDr. Alena Pastuchová, učo 357864 -
Mechanizmy rezistence nádorových buněk vůči chemoterapii
Mgr. Zuzana Šrámková, Ph.D. -
Fyziologické a patologické důsledky buněčné senescence
Mgr. Adéla Horáková, Ph.D. -
Získané chromozomové aberace vzniklé působením genotoxických faktorů prostředí
Bc. Eliška Zemanová




