Alternativa bakalářské práce

KCNN4 - málo známý gen aktivovaný p53

Non-canonical p53 target gene KCNN4

Sabira Bučan
Anotace

Nádorový supresor p53, často označovaný jako „strážce genomu“, prostřednictvím rozsáhlé transkripční sítě koordinuje řadu signálních drah. Ačkoli již byly popsány desítky známých cílových genů p53, které zajišťují zastavení buněčného cyklu, senescenci, opravu DNA a apoptózu, mnoho konzervovaných genů přímo regulovaných p53 zůstává přehlíženo a málo prozkoumáno. Draslíkový kanál aktivovaný vápníkem …více

Abstract

Tumor suppressor protein p53—often called the "guardian of the genome"—regulates numerous signaling pathways through its extensive transcriptional network. While dozens of well-established p53 target genes involved in cell cycle arrest, senescence, DNA repair, and apoptosis have been characterized, many conserved, directly regulated genes remain unnoticed and understudied. The calcium-activated potassium …více

Zadání alternativy bakalářské práce

TP53 is the most intensely researched gene in human genome. Despite of decades of enormous effort, there are many unanswered questions and understudied fields the TP53 biology. TP53 gene encodes a remarkable transcription factor p53 which directly transactivates about one hundred of conserved “core response” genes involved in multiple tumor-suppressive programs including apoptosis cell cycle arrest, DNA repair, or senescence. However, there is a group of genes undoubtedly regulated by p53 with poorly defined role in carcinogenesis and cellular response to p53 activation. One of such understudied p53 targets is KCNN4, a potassium calcium-activated channel gene.  
 
Rationale
Besides of several dozens of p53 target genes with well-defined function, many genes within this network represent a grey area of knowledge. Understanding better the role of those genes is required for elucidating tumor-suppressive mechanisms driven by p53. Importantly, as p53 activity is context-dependent with distinct characteristic influenced by differentiation, knowing more about p53 target genes is essential for defining roles of p53 across various tissues.    
 
Hypothesis
KCNN4 is induced by p53 activity in colorectal carcinoma lines on the protein level. 
 
Specific Aims
To test the hypothesis, we will pursuit following Specific Aims: 
Aim 1. To identify p53 RE in the KCNN4 locus. 
Aim 2. To verify KCNN4 induction on protein level by western blot.
Aim 3. To validate KCNN4 antibody specificity by KCNN4 suppression by shRNA.
 

Upozornění:

Závěrečná práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 14. 5. 2035.

Odůvodnění: Zveřejnění Závěrečného projektu je odloženo do 14.5.2035.

Jazyk alternativy bakalářské práce
angličtina angličtina
Termín rozpravy
26. 6. 2025
Rozprava proběhla úspěšně

Vedoucí

RNDr. Zdeněk Andrysík, Ph.D., učo 12323
VSZA BiolÚ Teorie LF MU

Zpravodaj

doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757
ÚBioch Chem PřF MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Aplikovaná biochemie
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.