Bakalářská práce

Cooperative RNA-binding of poly(A)-independent termination factors

Miroslav Brumovský, učo 323916
Anotace

Nrd1-komplex má klíčovou úlohu při terminaci transkripce nepolyadenylovaných RNA, mezi které patří například snRNA, snoRNA nebo kryptické nestabilní transkripty (CUTs). Proteiny Nrd1 a Nab3, které jsou součástí tohoto komplexu, spolu interagují a jsou schopné specificky vázat terminační elementy na nascentní RNA. Předpokládá se, že tato RNA-vazebná interakce je zprostředkovaná RNA-rozpoznávacími motivy …více

Abstract

The Nrd1 complex is a crucial element in transcription termination of non-polyadenylated RNAs, e. g. snRNAs, snoRNAs or cryptic unstable transcripts (CUTs). Two proteins, Nrd1 and Nab3, that are part of this complex, physically interact with each other. They can bind specifically to the termination elements in the nascent RNA. It is supposed that the RNA-binding is mediated via RNA-recognition motifs …více

Klíčová slova
RNA-protein interaction Nrd1 Nab3 yeast transcription termination non-coding RNA
Zadání práce
Tato práce bude součástí projektu ve kterém studujeme jak do dochází k ukončení transkripce nekodujících RNA. V předcházejících pokusech bylo zjištěno, že terminační signály jsou rozpoznávány proteiny Nrd1 and Nab3 a že oba proteiny váží RNA kooperativně. Komplex vytvořený z těchto proteinů je však velmi nestabilní a degraduje. Cílem práce bude nalézt a vytvořit minimální komplex proteinů Nrd1 and Nab3 který bude stabilní a bude stále vykazovat stejné vazebné vlastnosti na RNA. Práce bude zahrnovat zvladnutí technik s rekombinantní DNA a rekombinantními proteiny, exprese a purifikace rekombinantních proteinů z E. coli, charakterizace získaného proteinu a měření afinit mezi RNA a proteiny.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2011 09:10, prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
Plný text práce
1,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
14. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. María Victoria Marini Palomeque, Ph.D., učo 22912
VSLK BiolÚ Teorie LF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.