Závěrečná práce: Lucia Iľkovičová, učo 505319: Mapování vazby Tau a 14-3-3 proteinů s využitím chemického zesíťování
Bakalářská práce
Mapování vazby Tau a 14-3-3 proteinů s využitím chemického zesíťování
Mapping of Tau and 14-3-3 protein binding using chemical cross-linking
Anotace
Agregace β-amyloid proteinu a disociace tau proteinu z mikrotubul s jeho následným uložením do neurofibrilárních shluků jsou dva nejčastější patologické jevy pozorované ve spojení s Alzheimerovou chorobou. V druhém uvedeném případě bylo nalezeno mnoho proteinů, především z rodiny 14-3-3 proteinů, které interagovaly s tau, což naznačuje důležitost této interakce pro agregaci. Tato práce se zabývá interakcí …více
Abstract
The aggregation of β-amyloid protein and the dissociation of tau protein from microtubules and its deposition into neurofibrillary tangles are the most prevalent pathological features of Alzheimer's disease. In the latter case, many other proteins, especially proteins from the 14-3-3 family, associate with tau, indicating the importance of this interaction for aggregation. This thesis investigates …více
Zadání práce
Proteiny Tau a 14-3-3 jsou významné efektorové a regulační bílkoviny, především v savčím mozku. Bylo zjištěno, že zde mohou být zapojeny do vzniku lidských neurodegenerativních nemocí, jako např. Alzheimerova nemoc. Chemické zesíťování (XL-) je velmi slibná metoda, pomocí které je možno studovat interakční vlastnosti i vnitřně neuspořádaných proteinů (IDP), mezi něž patří Tau protein. Rozvoj spřažených metod hmotnostní spektrometrie (MS) umožňuje dosáhnout současně vysokého rozlišení a kvalitního popisu interagujících oblastí proteinů. Detailní popis komplexů Tau/14-3-3 bude vést k lepšímu pochopení jejich vztahu a posune možnosti návrhu různých modifikátorů této interakce.
Cílem práce je příprava zesíťovaných komplexů Tau proteinu s vybranými izoformami 14-3-3 proteinu a jejich elektroforetická analýza. Následně bude student provádět analýzu dat hmotnostní spektrometrie a jejich vizualizaci pomocí různých výpočtových nástrojů.
29. 5. 2023 08:09, doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Vypočetní simulace agreagace tau proteinu
Mgr. Lucia Iľkovičová, učo 505319 -
Studium struktury a interakcí fosforylovaného 14-3-3 proteinu
Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172 -
Charakteristika interakce izoforem 14-3-3 proteinu s tau proteinem
Mgr. Norbert Gašparik, učo 451748 -
Vazba Tau proteinu vybranými izoformami 14-3-3 proteinu
Bc. Tadeáš Zoubek -
Příprava rostlinných fosfoproteinů pro LC-MS/MS analýzu
Mgr. Jakub Kačenga -
Studium proteinových fosforylací pomocí hmotnostní spektrometrie
Mgr. Kateřina Hanáková, Ph.D., učo 357771 -
Studium interakce polynukleotidů s bioaktivními látkami
Mgr. Marek Vido -
Faktory indukující monomerizaci 14-3-3 proteinu
Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172




