Bakalářská práce

Analýza N-terminálních sekvencí bakteriálních lektinů

Analysis of N-terminal sequences from bacterial lectins

Daniela Repelová
Anotace

Bakalářská práce se zabývá in silico analýzou N-terminálních sekvencí pěti homologních lektinů z Gram-negativní bakterie Photorhabdus laumondii (PLL-PLL5). N-terminální sekvence slouží většinou jako signál, který určuje, jakým mechanizmem a kam bude protein po syntéze transportovaný. Avšak N-terminální sekvence těchto lektinů nevykazují typické vlastnosti signálních peptidů. Navíc není známa ani jejich …více

Abstract

The bachelor thesis is focused on an in silico analysis of N-terminal sequences of five homologous lectins from Gram-negative bacterium Photorhabdus laumondii (PLL-PLL5). The N-terminal sequences mostly serve as a signal that determines by which mechanism and where the protein will be transported after the synthesis. However, the N-terminal sequences of these lectins do not exhibit the typical properties …více

Klíčová slova
N-terminální sekvence signální peptid Photorhabdus laumondii predikce N-terminal sequence signal peptide prediction
Zadání práce
N-terminální sekvence proteinů slouží často jako signální sekvence, které určují lokalizaci proteinu. Vedle toho však také N-terminální konec definuje stabilitu proteinu in vivo a má význam i pro další úpravy proteinu. V mnoha případech jsou informace o N-terminálních sekvencích neúplné, což je mj. dáno tím, že často nevytvářejí definovanou sekundární či terciární strukturu. Náplní bakalářské práce bude analýza N-terminálních sekvencí lektinů pocházejících z bakterií rodu Photorhabdus s důrazem na in silico predikci jejich vlastností.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
2. 6. 2021 09:17, Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781
Plný text práce
1,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
8. 7. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781
NCBR PřF MU
prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
NCBR PřF MU

Literatura

  • JANČAŘÍKOVÁ, Gita; Josef HOUSER; Pavel DOBEŠ; Gabriel DEMO; Pavel HYRŠL a Michaela WIMMEROVÁ. Characterization of novel bangle lectin from Photorhabdus asymbiotica with dual sugar-binding specificity and its effect on host immunity. PLoS Pathogens. San Francisco: Public Library of Science, 2017, roč. 13, č. 8, s. 1-28. ISSN 1553-7366. Dostupné z: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1006564.
  • FUJDIAROVÁ, Eva; Josef HOUSER; Pavel DOBEŠ; Gita PAULÍKOVÁ; Nikolaj KONDAKOV; Leonid KONONOV; Pavel HYRŠL a Michaela WIMMEROVÁ. Heptabladed b-propeller lectins PLL2 and PHL from Photorhabdus spp. recognize O-methylated sugars and influence the host immune system. The FEBS Journal. Hoboken: Wiley, 2021, roč. 288, č. 4, s. 1343-1365. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/febs.15457.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.