Závěrečná práce: Mgr. Ondřej Strnad: Detection of pathways in large macromolecular structures
Rigorózní práce
Detection of pathways in large macromolecular structures
Anotace
Proteiny jsou základní složkou živých organismů a podílí se téměř na každém procesu uvnitř živé buňky. Detekce tunelů (specifických cest spojujících vnitřní část proteinu s jeho povrchem) uvnitř proteinu pomáhá biochemikům zaměřit se na konkrétní části proteinů, které mohou být důležité při chemické reakci. Vlastnosti tunelu (šířka, křivost, atd.) ovlivňují, jestli odlišná malá molekula je schopna …více
Abstract
Proteins are essential parts of organisms and participate in almost every process within living cells. Computation of tunnels inside a protein – specific pathways connecting the inner parts of the protein with its surface – help chemists to focus on the parts of the protein molecule which could be important in chemical reactions. The properties of a tunnel (such as width, curvature, etc.) determine …více
14. 10. 2011 08:53, prof. Ing. Jiří Sochor, CSc.
Oponenti
abs FI MU
FAV ZČU v Plzni
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Algorithms for Detecting Pathways in Large Protein Structures and Their Ensembles
RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D. -
Computation of channels in protein molecules
RNDr. Petr Medek, Ph.D., učo 39593 -
Computational Methods for Detecting Ligand Accessible Pathways
RNDr. Lukáš Pravda, Ph.D., učo 256262 -
Development of geometrical methods for protein engineering and analysis of protein structures
RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D. -
Analýza tunelů a pórů v proteinech
Bc. Eliška Špačková -
Analysis of Protein Structural Motifs
RNDr. David Sehnal, Ph.D., učo 140435 -
Bioinformatics tools for the analysis of macromolecular structures
RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D. -
Detekce asymetrických tunelů v proteinech pomocí Voroného diagramu
Mgr. Jakub Vallo




