Bakalářská práce

Design laboratorního experimentu pro fylogenetickou rekonstrukci vybraných genů u netopýrů s geomykózou

Laboratory experiment design for phylogeny reconstruction of bats with geomycosis based on selected genes

Bc. Zuzana Szolgayová, učo 323869
Anotace

Tato práce se zabývá infekčním onemocněním syndromem bílého nosu (WNS) u hibernujících netopýrů, které je způsobeno mikroskopickou plísní Geomyces destructants. Ta způsobuje nadměrné vypařování vody pokožkou, častější probouzení z hibernace a neočekávané ztráty tělesného tuku. Na následky onemocnění masově hynou populace netopýrů v Severní Americe. Výskyt onemocnění je v Evropě potvrzen, ale není doprovázen …více

Abstract

This thesis deals with the white-nose syndrome (WNS) disease infecting hibernating bats, which is cause by microscopic fungus Geomyces destructants. The fungus causes excessive water evaporation through skin, more frequent arousing, and unexpected looses of body fat. The populations of bats in the North America are dying massively because of WNS. The presence of the disease is also confirmed in Europe …více

Klíčová slova
WNS syndrom bílého nosu Geomyces destructans geomykóza Myotis netopýři fylogenetický strom neighbor-joining metoda metoda maximální věrohodnosti Bayesiánská analýza modely evoluce nukleotidové sekvence návrh primerů alignment mapování na referenční sekvenci white-nose syndrome geomycosis bats phylogenetic tree neighbor-joining method maximum likelihood method Bayesian analysis models of nucleotide sequence evolution primer design contig assembly
Zadání práce

Student si nastuduje používané metody rekonstrukce fylogenetických stromů pomocí DNA sekvencí a návrh primerů pro PCR amplifikaci. Sestaví alignment vybraných genů se známou funkcí při metabolismu vody z genomické sekvence Myotis lucifugus a sekvencí mRNA Myotis myotis. Zvolí úseky vhodné pro amplifikaci polymerázovou řetězovou reakcí a zároveň vhodné pro fylogenetickou rekonstrukci sekvencí DNA. Navrhne primery pro dané úseky exonů.

Bakalářská práce bude vypracována v anglickém jazyce.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
21. 5. 2013 10:01, doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
Plný text práce
3,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
12. 6. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
RECETOX PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Literatura

  • FELSENSTEIN, Joseph. Inferring phylogenies. Sunderland, Mass.: Sinauer Associates, 2004, xx, 664. ISBN 0878931775.
  • MARTÍNKOVÁ, Natália; Peter BAČKOR; Tomáš BARTONIČKA; Pavla BLAŽKOVÁ; Jaroslav ČERVENÝ; Lukáš FALTEISEK; Jiří GAISLER; Vladimír HANZAL; Daniel HORÁČEK; Zdeněk HUBÁLEK; Helena JAHELKOVÁ; Miroslav KOLAŘÍK; Ľuboš KORYTÁR; Alena KUBÁTOVÁ; Blanka LEHOTSKÁ; Roman LEHOTSKÝ; Radek LUČAN; Ondřej MÁJEK; Jan MATĚJŮ; Zdeněk ŘEHÁK; Jiří ŠAFÁŘ; Přemysl TÁJEK; Emil TKADLEC; Marcel UHRIN; Josef WAGNER; Dita WEINFURTOVÁ; Jan ZIMA; Jan ZUKAL a Ivan HORÁČEK. Increasing Incidence of Geomyces destructans Fungus in Bats from the Czech Republic and Slovakia. PLoS ONE. Sydney, Australia: Dee A. Carter, University of Sydney, Aus, 2010, roč. 5, č. 11, s. e13853, 7 s. ISSN 1932-6203.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.