Diplomová práce

Diverzita, evoluce a selekce u genů kódujících toll-like receptory TLR2 a TLR9 u čeledi Equidae

Diversity, evolution and selection of genes encoding toll-like receptors TLR2 and TLR9 in the family Equidae

Bc. Hana Paclíková, učo 357978
Anotace

Toll- like receptory hrají důležitou roli ve vrozené imunitní odpovědi. Zatímco TLR2 interaguje extracelulárně s bakteriálními ligandy, TLR9 váže virové komponenty v endosomech. Kompletní kódující sekvence těchto genů nebyly dosud známy u jiných equidů než u koní. Hlavním cílem této studie stanovit sekvence 9 druhů z této čeledi, lokalizovat jejich mezidruhovou variabilitu a případné SNPs a srovnat …více

Abstract

Toll- like receptors play an important role in the innate immune responses. While TLR2 interacts with bacterial extracellular ligands, TLR9 binds viral components in endosomes. The complete coding sequences of those genes have so far not been reported in other equids than in horses. The main objectives of this study were to determine coding nucleotide sequences of the TLR2 and TLR9 genes in all available …více

Klíčová slova
Toll-like receptory TLR Equidae Koňovití TLR2 TLR9 Mezidruhová variabilita TSP SNP Polymorfismus Fylogeneze Zebry Osli Toll-like receptors Horse family Trans-species polymorphism Polymorphism Phylogeny Zebras Donkeys
Zadání práce
Metodou masivního paralelního sekvenování genomové DNA určit kompletní protein- kódující nukleotidovou sekvenci genů pro toll-like receptory TLR2 a TLR9 u všech zástupců čeledi Equidae (koně, osli, zebry). U získaných a již dostupných genomických sekvencí analyzovat mezidruhové rozdíly a vnitrodruhový polymorfizmus. Na základě znalostí nukleotidových sekvencí a odvozených aminokyselinových sekvencí sestavit fylogenetické stromy. Získaná data dále použít k analýze pozitivní selekce v těchto genech za využití standardních bioinformatických metod.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
12. 1. 2017 11:14, prof. MVDr. RNDr. Petr Hořín, CSc., učo 36728
Plný text práce
1,2 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
15. 2. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MVDr. RNDr. Petr Hořín, CSc., učo 36728
ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

prof. RNDr. Aleš Knoll, PhD.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Ekologická a evoluční biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.