Bakalářská práce

Metody analýzy vlivu mutací na proces sestřihu pre-mRNA

Methods for deciphering the impact of mutations on pre-mRNA splicing

Petra Pešková
Anotace

V této práci jsem se věnovala různým možnostem analýzy vlivu mutací, které ovlivňují proces sestřihu pre-mRNA. Takovéto mutace pak mohou vést k vynechání exonu, aberantnímu sestřihu mRNA při využití kryptického místa sestřihu či retenci intronu v mRNA. To vše může vést k inzercím nebo delecím aminokyselin v proteinu, ale často také ke změně čtecího rámce transkriptu, s čímž souvisí vysoká pravděpodobnost …více

Abstract

In this thesis, I focused on the different ways, how to analyse the impact of mutations on pre-mRNA splicing. This type of mutations can lead to exon skipping, aberant splicing of mRNA using cryptic splice site, or to retention of whole intron in mRNA. Each of these mutations can raise insertion or deletion of amino acids in protein. Mutations can cause generation of premature stop codons due to displacement …více

Zadání práce
Mutace ovlivňující sestřih pre-mRNA představují významnou část (podle přibližných odhadů 15 až 50 %) genových aberací způsobujících mendelisticky dědičná onemocnění. Porušení normálního sestřihu nezřídka mívá pro genovou expresi fatální následky. Vlivem sestřihové mutace může dojít například k vynechání exonu z mRNA, aberantnímu sestřihu mRNA v „pseudomístě“, nebo retenci intronu v mRNA. To vše může vést k inzercím a delecím aminokyselin v proteinu, ale často také ke změně čtecího rámce transkriptu, s čímž souvisí vysoká pravděpodobnost vzniku předčasných terminačních kodonů. Soudobé výzkumy ukazují, že značná část patologických exonových mutací jsou zřejmě nerozpoznané sestřihové mutace. Tyto mutace bývají v diagnostických laboratořích poněkud opomíjeny: jednak proto, že se na mutace pohlíží zejména z hlediska jejich vlivu na sekvenci proteinu, za druhé proto, že sestřihovou mutaci není snadné rozpoznat přímo ze sekvence DNA, zejména kvůli málo konzervativnímu charakteru sekvencí regulujících sestřih. Přesto nebo naopak právě proto se v dnešní době oblast výzkumu sestřihových mutací bouřlivě rozvíjí, stejně jako metodika k tomuto účelu používaná. Cílem bakalářské práce je zmapování metod, které se pro analýzu vlivu mutací na proces sestřihu využívají.
Práce zkontrolována:
23. 5. 2012 11:42, prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D., učo 24036
Plný text práce
1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D., učo 24036
ÚKIA FN USA LF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.