Diplomová práce

Nalezení genů rezistence jahodníku velkoplodého (Fragaria, ananassa)

Finding resistance genes of strawberry (Fragaria, ananassa)

Bc. Terézia Sabadková
Anotace

Většina mikroorganismů, přirozeně se vyskytujících v prostředí, nemůže být kultivována v laboratorních podmínkách. Z toho důvodu byl vyvinutý vědní obor metagenomika, který dovoluje analýzu mikrobiálních společenstev v jejich přirozeném životním prostředí. Jahody, stejně jako jiné polnohospodářsky významné rostliny, čelí ve svém životním cyklu nejen vlivu prostředí, ale také vlivu mikroorganismů. Za …více

Abstract

Most of the microorganisms that are occurring naturally cannot be cultivated in laboratory conditions, therefore a scientific department called metagenomics has been developed. The metagenomics allows the analysis of microbial communities in their natural habitat. In the life cycle of the strawberries as well as other the other agriculturally important plants not only environment takes effect on the …více

Klíčová slova
Fragaria ananassa Phytophthora cactorum plant immune system transcriptome metagenomic sequencing next generation sequencing rastlinná imunita transkriptom sekvenovanie metagenomu sekvenovanie novej generácie
Zadání práce

Fytopatogenní organizmus, oomycet - Phytophthora cactorum, je významným patogenem širokého spektra rostlin. V praxi představuje problém v lesních školkách, kde způsobuje padání semenáčků lesních dřevin, v kulturních výsadbách poškozuje kořeny okrasných i ovocných dřevin, a je zejména jedním z nejvýznamnějších problémů v porostech jahodníku. V rámci nedávného projektu Výzkumný ústav rostlinné výroby (VÚRV) bylo zjištěno, že populace P. cactorum zahrnuje nejméně pět různých genetických linií, z nichž některé vykazují hostitelskou specificitu k jahodníku, jiné jsou specifické k dalším hostitelským druhům rostlin. Po infekci rostlin izoláty s různou virulencí bude v čase sledována změna transkriptomu patogenu i hostitelské rostliny a zjištěny rozdíly v expresi genů virulence u patogenu a genů rezistence u jahodníku. Informace o genech rezistence je poté široce využitelná v rámci rostlinné biotechnologie k dalšímu šlechtění a molekulárnímu křížení rezistentních odrůd.

Cíle práce:

  • Analýza mykobiomu v půdě a kořenovém systému jahodníků rostoucích v polních podmínkách na vybraných lokalitách
  • Analýza změn transkriptomu jednotlivých kmenů P. cactorum vykazujících hostitelskou specificitu v průběhu patogeneze.
  • Analýza změn transkriptomu jahodníku velkoplodého po aplikaci fytopatogenního oomycetu Phytophthora cactorum.

    • Administrativní informace
    Práce zkontrolována:
    20. 5. 2022 08:06, doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D., učo 13418
    Plný text práce
    2,3 MB / soubor PDF
    Jazyk práce
    slovenština slovenština
    Termín obhajoby
    16. 6. 2022
    Práce byla úspěšně obhájena

    Vedoucí

    doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D., učo 13418
    ÚPF Teorie LF MU

    Oponent

    Mgr. Markéta Pernisová, Ph.D., učo 11554
    NCBR PřF MU
    Citovat tuto práci
    Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
    Studijní program
    Plán
    Biotechnologie

    Práce na příbuzné téma

    Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

    Podobné práce

    • Přidání souboru

      Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

    • Další operace se soubory

      Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

    • Pohled pro experty

      Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

    • Vyhledávání souborů

      Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

    • Rychlý přístup k souborům

      Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.